116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1293 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1293  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
549 aa  1119    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.619814  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0460  polysaccharide transporter  45.42 
 
 
552 aa  473  1e-132  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000146874  normal  0.345583 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0636  polysaccharide transporter  35.81 
 
 
647 aa  352  8.999999999999999e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.217916  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0388  polysaccharide transporter  39.59 
 
 
543 aa  347  4e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.379787  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0846  polysaccharide transporter  37.06 
 
 
554 aa  342  8e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.151438  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1390  polysaccharide biosynthesis protein, putative  34.48 
 
 
544 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.106495  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1986  hypothetical protein  34.37 
 
 
557 aa  314  1.9999999999999998e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2760  polysaccharide biosynthesis protein  30.87 
 
 
542 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.874111  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0673  polysaccharide biosynthesis protein  32.03 
 
 
541 aa  266  8e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4538  polysaccharide biosynthesis protein  29.46 
 
 
550 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4819  polysaccharide synthase family protein  29.46 
 
 
550 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0294842  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0417  polysaccharide synthase family protein  29.27 
 
 
550 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00377185  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4849  polysaccharide biosynthesis family protein  29.64 
 
 
550 aa  259  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1809  polysaccharide biosynthesis protein  31.57 
 
 
553 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1844  polysaccharide biosynthesis protein  31.57 
 
 
553 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1439  polysaccharide biosynthesis protein  30.18 
 
 
544 aa  254  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.30396  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3370  polysaccharide biosynthesis protein  29.83 
 
 
550 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0247135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4457  polysaccharide biosynthesis family protein; export protein for polysaccharides and teichoic acids  29.98 
 
 
550 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0642469  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4842  polysaccharide synthase family protein  29.98 
 
 
550 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00735996  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4603  polysaccharide biosynthesis family protein  29.98 
 
 
550 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0339143  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4439  polysaccharide biosynthesis family protein; export protein for polysaccharides and teichoic acids  29.98 
 
 
550 aa  247  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4959  polysaccharide biosynthesis family protein  29.98 
 
 
550 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4824  polysaccharide synthase family protein  29.98 
 
 
550 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1957  polysaccharide synthase family protein  30.97 
 
 
544 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.55468  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0493  polysaccharide transporter  31.89 
 
 
527 aa  243  5e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1878  polysaccharide synthase family protein  29.95 
 
 
544 aa  243  9e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0013771 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1681  polysaccharide biosynthesis family protein  29.67 
 
 
544 aa  242  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.960771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1656  polysaccharide biosynthesis protein; spore cortex protein  29.49 
 
 
544 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.177668  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1922  polysaccharide biosynthesis family protein  29.49 
 
 
544 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1694  polysaccharide biosynthesis protein  30.6 
 
 
544 aa  241  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196134  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1700  polysaccharide biosynthesis family protein  30.62 
 
 
544 aa  240  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.312469  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1834  polysaccharide biosynthesis family protein  30.62 
 
 
544 aa  240  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1313  polysaccharide biosynthesis protein  30.87 
 
 
553 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.221909  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0905  polysaccharide transporter  32.58 
 
 
484 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2039  polysaccharide synthase family protein  30.11 
 
 
459 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3270  polysaccharide synthase family protein  29.91 
 
 
459 aa  210  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2081  polysaccharide synthase family protein  30.57 
 
 
459 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1902  polysaccharide biosynthesis family protein  30.34 
 
 
459 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0218585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1865  export protein for polysaccharides and teichoic acids  30.34 
 
 
459 aa  208  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2049  polysaccharide biosynthesis family protein  30.34 
 
 
459 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.686608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2150  polysaccharide synthase family protein  30.14 
 
 
459 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.230641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2118  polysaccharide biosynthesis family protein  30.11 
 
 
459 aa  206  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1855  export protein for polysaccharides and teichoic acids  30.11 
 
 
459 aa  206  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.383858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1899  polysaccharide biosynthesis protein  29.52 
 
 
459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00909179  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1538  polysaccharide biosynthesis protein  29.43 
 
 
459 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0542726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3064  polysaccharide biosynthesis protein  27.58 
 
 
535 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000038595  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0117  polysaccharide biosynthesis protein  24.66 
 
 
564 aa  140  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2607  virulence factor MVIN family protein  24.04 
 
 
544 aa  139  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0782  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 
519 aa  128  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0081  stage V sporulation protein B  25.94 
 
 
517 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0785  polysaccharide biosynthesis protein  25.44 
 
 
506 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4400  polysaccharides export protein  25.17 
 
 
506 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  hitchhiker  0.0000000000248278 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0931  polysaccharides export protein  25.16 
 
 
506 aa  120  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.201799  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0971  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  24.43 
 
 
506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.931032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0712  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 
506 aa  114  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2328  polysaccharide biosynthesis protein  26.45 
 
 
534 aa  114  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1062  polysaccharide synthase family protein  24.69 
 
 
506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000239702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0839  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  24.69 
 
 
506 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0883  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  24.69 
 
 
506 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0972  polysaccharide synthase family protein  24.69 
 
 
506 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0956622 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0787  polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 
506 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496201  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2804  stage V sporulation protein B  25.24 
 
 
510 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2490  stage V sporulation protein B  25 
 
 
510 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0054  stage V sporulation protein B  21.98 
 
 
533 aa  107  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0054  stage V sporulation protein B  21.98 
 
 
533 aa  107  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0061  polysaccharide synthase family protein  22.87 
 
 
533 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0050  integral membrane protein; stage V sporulation protein B  21.79 
 
 
533 aa  104  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131494  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1366  stage V sporulation protein B  24.33 
 
 
516 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0345658 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0050  integral membrane protein; stage V sporulation protein B  21.6 
 
 
533 aa  103  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0050  polysaccharide biosynthesis protein  22.39 
 
 
533 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1413  stage V sporulation protein B  24.57 
 
 
538 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.208509  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1223  stage V sporulation protein B  23.91 
 
 
538 aa  100  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.30797  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0050  polysaccharide biosynthesis protein  22.2 
 
 
529 aa  100  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1794  polysaccharide biosynthesis protein  25.53 
 
 
535 aa  99.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000923307  normal  0.17508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0053  stage V sporulation protein B, putative  21.79 
 
 
533 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5256  polysaccharide synthase family protein  22.09 
 
 
533 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  22.39 
 
 
539 aa  97.4  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0064  polysaccharide synthase family protein  21.6 
 
 
533 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0060  polysaccharide synthase family protein  22.93 
 
 
533 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0009  polysaccharide biosynthesis protein  25.24 
 
 
526 aa  95.9  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1230  polysaccharide biosynthesis protein  23.09 
 
 
522 aa  92.8  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0449934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1761  polysaccharide biosynthesis protein  24.51 
 
 
515 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0052  polysaccharide biosynthesis protein  23.95 
 
 
526 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22040  polysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 
517 aa  88.2  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0598  stage V sporulation protein B  23.87 
 
 
513 aa  79.7  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2974  stage V sporulation protein B  20.89 
 
 
512 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0142  polysaccharide biosynthesis protein  22.98 
 
 
513 aa  76.3  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0050  polysaccharide biosynthesis protein  23.3 
 
 
516 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1338  polysaccharide biosynthesis protein  21.75 
 
 
514 aa  73.2  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179971  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0526  polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 
508 aa  73.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0539  polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 
508 aa  73.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.41345  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2104  stage V sporulation protein B  22.17 
 
 
529 aa  67.8  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1143  polysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 
514 aa  68.2  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1900  stage V sporulation protein B  22.63 
 
 
509 aa  65.9  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000710979  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1619  stage V sporulation protein B  22.63 
 
 
509 aa  65.1  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00148254  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2939  stage V sporulation protein B  21.79 
 
 
522 aa  63.5  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000274011  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0815  polysaccharide biosynthesis protein  21.08 
 
 
495 aa  59.3  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0992616  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0529  polysaccharide biosynthesis protein  19.44 
 
 
518 aa  58.9  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2688  polysaccharide biosynthesis protein  21.96 
 
 
517 aa  56.2  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2515  stage V sporulation protein B  25.45 
 
 
520 aa  53.5  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0654527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>