More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1270 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 562 aa  1155    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  54.26 
 
 		 564 aa  627  1e-178  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 		 563 aa  624  1e-177  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 563 aa  609  1e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 		 563 aa  594  1e-168  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 		 564 aa  587  1e-166  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 566 aa  578  1.0000000000000001e-163  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 562 aa  568  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 		 562 aa  569  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 		 562 aa  568  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 562 aa  567  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  49.73 
 
 		 562 aa  565  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  49.73 
 
 		 562 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  49.73 
 
 		 562 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 		 562 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 562 aa  554  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 562 aa  550  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 566 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  46 
 
 		 566 aa  504  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 565 aa  501  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 565 aa  498  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 565 aa  497  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 565 aa  484  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  51.15 
 
 		 433 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 624 aa  451  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 580 aa  362  8e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38727  arginyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 603 aa  336  7e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.908762 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 		 572 aa  320  6e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  35.27 
 
 		 574 aa  319  9e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 		 571 aa  312  1e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 		 640 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 613 aa  296  5e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 		 581 aa  286  5e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  31.73 
 
 		 585 aa  285  1.0000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 		 581 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  32.59 
 
 		 581 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 		 581 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 		 581 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 		 581 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01310  arginine-tRNA ligase, putative  32.18 
 
 		 622 aa  282  1e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0173932  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 		 581 aa  281  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 		 591 aa  280  5e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45360  arginyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 		 579 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621239  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 		 590 aa  278  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 		 576 aa  278  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3779  arginyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 581 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 		 581 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5138  arginyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 		 578 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447973  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 		 581 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3762  arginyl-tRNA synthetase  32.67 
 
 		 581 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0761225  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 		 576 aa  273  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 		 576 aa  272  9e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4962  arginyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 		 578 aa  272  9e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 576 aa  272  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 		 579 aa  271  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  31.98 
 
 		 581 aa  271  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5089  arginyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 578 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5139  arginyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 		 578 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 		 581 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0397  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 579 aa  270  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  33.74 
 
 		 576 aa  268  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  32.97 
 
 		 581 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  32.97 
 
 		 581 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  32.97 
 
 		 581 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0399  arginyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 		 578 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 576 aa  268  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1577  arginyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 		 590 aa  266  5e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 577 aa  266  5.999999999999999e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 577 aa  266  8.999999999999999e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 577 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 577 aa  265  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 		 577 aa  265  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 577 aa  266  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 577 aa  265  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  33.1 
 
 		 577 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06368  arginyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G14030)  28.69 
 
 		 650 aa  265  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.908063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 577 aa  265  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02051  arginyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 		 603 aa  264  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 		 576 aa  264  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0376  arginyl-tRNA synthetase  32.57 
 
 		 578 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2442  arginyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 		 577 aa  262  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5788  arginyl-tRNA synthetase  34.02 
 
 		 587 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1359  arginyl-tRNA synthetase  32.97 
 
 		 578 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66750  arginyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 		 587 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3671  arginyl-tRNA synthetase  32.43 
 
 		 585 aa  257  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3956  arginyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 		 574 aa  256  6e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 		 576 aa  256  6e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  31.91 
 
 		 577 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2069  arginyl-tRNA synthetase  31.43 
 
 		 577 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205082 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4134  arginyl-tRNA synthetase  32.06 
 
 		 577 aa  255  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440291  hitchhiker  0.000000042149 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  31.43 
 
 		 577 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2270  arginyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 		 576 aa  254  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  31.43 
 
 		 577 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  31.43 
 
 		 577 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0006  arginyl-tRNA synthetase  31.66 
 
 		 582 aa  253  5.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0535  arginyl-tRNA synthetase  32.53 
 
 		 579 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0269  arginyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 		 576 aa  251  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3238  arginyl-tRNA synthetase  31.62 
 
 		 585 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 577 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2110  arginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 577 aa  248  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.102153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>