245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1249 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1249  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000770984  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1502  integral membrane protein, interacts with FtsH  67.93 
 
 		 243 aa  340  1e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.230664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0993  integral membrane protein, interacts with FtsH  62.87 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000120831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1398  hypothetical protein  59.49 
 
 		 235 aa  251  7e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0710  integral membrane protein, interacts with FtsH  36.91 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0741139  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1268  integral membrane protein, interacts with FtsH  36.63 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.01414  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1604  hypothetical protein  36.99 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000120987  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0950  hypothetical protein  37.39 
 
 		 240 aa  132  3e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.816971  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1143  hypothetical protein  41.38 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1517  hypothetical protein  37.55 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2518  protein of unknown function UPF0005  36.03 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0945287  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2947  protein of unknown function UPF0005  37.97 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00753  predicted inner membrane protein  37.25 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2856  protein of unknown function UPF0005  37.25 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2566  hypothetical protein  37.25 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2857  hypothetical protein  37.25 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496163 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0849  hypothetical protein  37.25 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0840  hypothetical protein  37.25 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00770  hypothetical protein  37.25 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0956  inner membrane protein YbhL  37.04 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0870  membrane protein  37.04 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0933  hypothetical protein  37.04 
 
 		 237 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0901  inner membrane protein YbhL  37.04 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6925  hypothetical protein  38.33 
 
 		 239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0842  inner membrane protein YbhL  37.04 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0809  hypothetical protein  36.44 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00257878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1278  hypothetical protein  39.21 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.278652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0934  hypothetical protein  36.84 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1325  hypothetical protein  35.8 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.891235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1173  protein of unknown function UPF0005  35.98 
 
 		 240 aa  125  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00047203  normal  0.359337 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2779  hypothetical protein  37.45 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.196634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1438  hypothetical protein  34.01 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4182  hypothetical protein  33.98 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.253743  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0009  hypothetical protein  34.89 
 
 		 233 aa  122  5e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.0000179437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2832  hypothetical protein  34.01 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2918  hypothetical protein  34.01 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.117943  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0937  hypothetical protein  34.23 
 
 		 234 aa  122  7e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419647  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6220  hypothetical protein  35.78 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2134  protein of unknown function UPF0005  35.53 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000183428  normal  0.170874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3782  protein of unknown function UPF0005  35.34 
 
 		 249 aa  119  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2427  protein of unknown function UPF0005  34.98 
 
 		 236 aa  118  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3353  hypothetical protein  35.42 
 
 		 248 aa  118  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3668  hypothetical protein  38.33 
 
 		 244 aa  118  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16725  hitchhiker  0.0000130091 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0296  integral membrane protein, interacts with FtsH  35.14 
 
 		 229 aa  118  9e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1395  hypothetical protein  33.86 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.681625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1912  protein of unknown function UPF0005  34.98 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224132 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4057  protein of unknown function UPF0005  34.22 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4482  protein of unknown function UPF0005  41.04 
 
 		 236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3076  hypothetical protein  35.87 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1899  integral membrane protein, interacts with FtsH  32.43 
 
 		 237 aa  116  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0383513  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3734  protein of unknown function UPF0005  35.87 
 
 		 242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2543  protein of unknown function UPF0005  36.25 
 
 		 255 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.0807809 
 
 
-
 
NC_002950  PG0795  hypothetical protein  39.89 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2081  protein of unknown function UPF0005  42 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0430200000000002e-29 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2225  protein of unknown function UPF0005  36.67 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0352825 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6013  protein of unknown function UPF0005  34.02 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0713321 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2135  protein of unknown function UPF0005  42 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000126881  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0088  hypothetical protein  36.13 
 
 		 245 aa  111  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4550  hypothetical protein  34.39 
 
 		 236 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145642 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3093  integral membrane protein  36.99 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.718082  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7161  protein of unknown function UPF0005  34.39 
 
 		 236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147509  normal  0.897358 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0086  hypothetical protein  36.13 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1390  hypothetical protein  34.29 
 
 		 256 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3820  hypothetical protein  36.99 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2043  hypothetical protein  39.77 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28558  normal  0.977268 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0529  hypothetical protein  32.53 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0200  hypothetical protein  32.59 
 
 		 271 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3673  hypothetical protein  36.99 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.915645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0912  hypothetical protein  33.03 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.409421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0671  hypothetical protein  32.08 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  decreased coverage  0.00362929 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1889  hypothetical protein  32.08 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1779  protein of unknown function UPF0005  33.99 
 
 		 274 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1913  hypothetical protein  30.83 
 
 		 259 aa  108  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.841584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0536  hypothetical protein  32.08 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0772  hypothetical protein  34.23 
 
 		 233 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.768217  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0443  hypothetical protein  33.05 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1019  hypothetical protein  31.75 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.219255  normal  0.241296 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3648  protein of unknown function UPF0005  30.83 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000291773  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5468  hypothetical protein  33.6 
 
 		 274 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0813  hypothetical protein  35.91 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0875239  hitchhiker  0.00101032 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0050  putative membrane proetin  32.61 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0413  hypothetical protein  31.33 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1724  hypothetical protein  34.04 
 
 		 235 aa  105  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000390624  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1437  protein of unknown function UPF0005  33.17 
 
 		 219 aa  105  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0287  hypothetical protein  31.73 
 
 		 263 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0137467 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0738  protein of unknown function UPF0005  38.29 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000107382  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2601  membrane protein, putaive  33.19 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232013  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4126  protein of unknown function UPF0005  38.69 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0129  hypothetical protein  35.64 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.576127 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4095  protein of unknown function UPF0005  38.1 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0100  hypothetical protein  38.15 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3983  hypothetical protein  38.41 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0386  putative transport protein  31.25 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0927  protein of unknown function UPF0005  31.67 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.441127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0849  hypothetical protein  35.15 
 
 		 242 aa  102  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.272287 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0001  hypothetical protein  41.96 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0302  hypothetical protein  33.5 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171893  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0549  hypothetical protein  31.4 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.235256  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0828  hypothetical protein  41.21 
 
 		 256 aa  99.4  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2268  hypothetical protein  32.92 
 
 		 294 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.476385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>