244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1240 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1240  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 65 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000491229  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1279  50S ribosomal protein L35P  79.03 
 
 		 65 aa  104  5e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.686056  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1442  50S ribosomal protein L35  74.19 
 
 		 65 aa  97.8  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000414498  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1408  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.62666e-18  unclonable  7.5203e-29 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2032  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 		 66 aa  75.5  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000178716  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1383  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000504728  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1088  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 66 aa  73.9  0.0000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000177578  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  44.62 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28670  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000017021 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2506  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684912  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 64 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  43.75 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  40.62 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1998  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0506186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1801  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00132404  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2059  ribosomal protein L35  49.18 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617937  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3042  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173164  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl189  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172022  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  48.44 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  44.44 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf193  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 62 aa  53.5  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000550484  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  37.5 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  37.5 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1579  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0204  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003714  LSU ribosomal protein L35p  43.75 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000181829  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20440  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.836721  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0170  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00827937  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1758  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  40.62 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02081  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3479  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0370445  normal  0.0138501 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2467  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1714  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406642  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1822  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000837501  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3223  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0165  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2623  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  50.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2301  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  50.4  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000837102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1645  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 65 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354073  normal  0.121255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1975  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 65 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2164  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000105441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2016  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000210298  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0493  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0940  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000354984  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1767  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852967  normal  0.0187188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>