More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1227 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 491 aa  1012    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0255402  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  42.28 
 
 		 513 aa  382  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1731  Signal transduction histidine kinase  53.87 
 
 		 366 aa  345  1e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000205849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  36.65 
 
 		 472 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1700  Signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 429 aa  278  1e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0217075  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  36.68 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  35.52 
 
 		 471 aa  264  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 		 465 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1624  sensor histidine kinase CsrS  31.62 
 
 		 501 aa  257  3e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0265731  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0988  sensor histidine kinase ArlS  34.47 
 
 		 456 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101467  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1475  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 451 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1504  ATPase domain-containing protein  35.69 
 
 		 451 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2057  sensor histidine kinase  36.8 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2213  sensor histidine kinase  36.8 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2241  sensor histidine kinase  36.23 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5912199999999999e-27 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2195  sensor histidine kinase  35.93 
 
 		 452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00104327  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  38.99 
 
 		 397 aa  193  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 452 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0153  histidine kinase  37.78 
 
 		 411 aa  188  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.519807  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  33.13 
 
 		 490 aa  187  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  33.54 
 
 		 469 aa  186  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 470 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  34.78 
 
 		 497 aa  182  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 504 aa  179  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 477 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 425 aa  173  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  28.82 
 
 		 477 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 479 aa  173  7.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2267  histidine kinase  33.94 
 
 		 488 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.643176  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  31.78 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  33.23 
 
 		 486 aa  171  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2230  histidine kinase  35.61 
 
 		 494 aa  170  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4440  histidine kinase  38.69 
 
 		 480 aa  170  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 474 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 472 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 		 459 aa  167  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1872  histidine kinase  35.65 
 
 		 482 aa  167  5e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 509 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 438 aa  166  6.9999999999999995e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 469 aa  166  9e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  32.05 
 
 		 481 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1057  sensor histidine kinase  38.71 
 
 		 418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197208  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1092  Signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 441 aa  163  5.0000000000000005e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0028584  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 475 aa  163  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 469 aa  162  9e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2798  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 490 aa  162  9e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000774606  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 471 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  37.45 
 
 		 565 aa  161  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 469 aa  161  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  31.52 
 
 		 475 aa  160  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  35.53 
 
 		 469 aa  160  5e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  32.63 
 
 		 503 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1045  histidine kinase  36.02 
 
 		 457 aa  159  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 455 aa  159  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 487 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0492  sensor histidine kinase/response regulator  35.16 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.189978  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 504 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 		 524 aa  156  7e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  29.19 
 
 		 477 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 389 aa  155  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  32.48 
 
 		 461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  28.08 
 
 		 436 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  32.68 
 
 		 463 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  32.68 
 
 		 463 aa  153  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  32.48 
 
 		 462 aa  153  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2945  histidine kinase  30.22 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0517153  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  32.68 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  32.68 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 515 aa  152  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  30.9 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  31.8 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  28.67 
 
 		 473 aa  152  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00270  signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 447 aa  152  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230413 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 641 aa  151  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  32.35 
 
 		 463 aa  150  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0736  histidine kinase  33.78 
 
 		 508 aa  149  9e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02950  signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 544 aa  149  9e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  30.33 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 554 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  34.51 
 
 		 554 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  29.39 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  29.39 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  29.39 
 
 		 436 aa  148  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2265  histidine kinase  35.98 
 
 		 429 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.19602  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 365 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2439  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 537 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 582 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 639 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1333  histidine kinase  37.99 
 
 		 226 aa  147  4.0000000000000006e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000137869  decreased coverage  0.000238136 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  31.65 
 
 		 310 aa  147  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 621 aa  146  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  27.25 
 
 		 436 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  37.02 
 
 		 613 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  31.65 
 
 		 473 aa  146  9e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0489  Signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 470 aa  146  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>