More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1219 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1219  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 112 aa  231  3e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000243781  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0446  transcriptional regulator  51.4 
 
 		 122 aa  120  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.560088  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1393  transcriptional regulator  57 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000189359  hitchhiker  8.40763e-24 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  53.54 
 
 		 124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4874  transcriptional regulator  50 
 
 		 107 aa  103  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4889  transcriptional regulator  50 
 
 		 107 aa  103  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5044  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5360  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3732  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00142315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5302  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5315  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5428  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5284  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000956827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5643  hypothetical protein  49.04 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00272116  hitchhiker  0.0000000000000412224 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4989  HxlR family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  46.79 
 
 		 113 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4243  transcriptional regulator, HxlR family  40.19 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.790353  normal  0.125727 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  44.9 
 
 		 120 aa  92  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2191  transcriptional regulator, HxlR family  43.88 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 116 aa  84  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0916  transcriptional regulator  45.16 
 
 		 102 aa  84  7e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000825483  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0758  transcriptional regulator, HxlR family  47.83 
 
 		 98 aa  83.6  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  37.89 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3399  transcriptional regulator, MarR family  40.59 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0154  transcriptional regulator  40.59 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3098  MarR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  40.23 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3041  transcriptional regulator, HxlR family  36.26 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  36.67 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3884  putative transcriptional regulator  31.37 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  39.8 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  35.05 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1415  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0193281 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  37.11 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  34.65 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0273  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.394727  normal  0.0155741 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4559  transcriptional regulator, HxlR family  37.84 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4029  transcriptional regulator, HxlR family  36.94 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  38.1 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  37.08 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  34.02 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  42.17 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2640  transcriptional regulator, HxlR family  36.08 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.954281  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  38.95 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  36.56 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  37.38 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  34.07 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1273  HxlR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.866565  hitchhiker  0.0000000994853 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0386  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  41.46 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  32.67 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  36.78 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2207  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386773  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  37.36 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  41.46 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  34.69 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1262  transcriptional regulator, HxlR family  35.71 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  41.46 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  41.46 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  35.42 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  41.46 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  35.42 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 235 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  32.58 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  41.46 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  39.18 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  37.21 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  32.97 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  35.64 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3534  transcriptional regulator, HxlR family  30.48 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  34.09 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  34.62 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  34.83 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2092  HxlR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 216 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821202  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0952  transcriptional regulator  36.05 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000720896  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  32.35 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  31.03 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0879  transcriptional regulator, HxlR family  33.68 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.40376  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  32.95 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>