18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1212 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1212  membrane protein-like protein  100 
 
 		 871 aa  1790    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000118346  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0473  hypothetical protein  38.43 
 
 		 869 aa  587  1e-166  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1245  hypothetical protein  36.69 
 
 		 880 aa  540  9.999999999999999e-153  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.816552  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1388  hypothetical protein  30.02 
 
 		 859 aa  334  4e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000211838  hitchhiker  2.84061e-22 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0277  hypothetical protein  28.3 
 
 		 903 aa  276  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0155701  normal  0.111669 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2172  hypothetical protein  25.03 
 
 		 859 aa  209  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.272358  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0893  hypothetical protein  25.42 
 
 		 883 aa  200  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.262906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8841  hypothetical protein  22.91 
 
 		 964 aa  172  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.920014 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5554  multidrug resistance protein B  20.73 
 
 		 892 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5395  multidrug resistance protein B  20.73 
 
 		 888 aa  119  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3949  multidrug resistance protein B  20.37 
 
 		 894 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1996  hypothetical protein  22.76 
 
 		 623 aa  110  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.863405  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0883  membrane protein-like protein  22.71 
 
 		 962 aa  64.7  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000534965  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14380  membrane protein YfhO  20.32 
 
 		 933 aa  50.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.966469  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0636  hypothetical protein  31.4 
 
 		 800 aa  49.3  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.69308  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12000  membrane protein YfhO  25.1 
 
 		 1140 aa  48.9  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1843  hypothetical protein  44.44 
 
 		 870 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882211  normal  0.181508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3354  hypothetical protein  50 
 
 		 726 aa  45.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>