279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1208 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  100 
 
 		 219 aa  430  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  43.58 
 
 		 386 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  41.71 
 
 		 389 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  37.56 
 
 		 228 aa  141  9e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  36.24 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  33.51 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  36.81 
 
 		 487 aa  115  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  36.81 
 
 		 487 aa  115  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  34.5 
 
 		 356 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  37.09 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  34.81 
 
 		 486 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  35.96 
 
 		 327 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  39.33 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  35.36 
 
 		 230 aa  102  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  30.92 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  38.51 
 
 		 523 aa  98.2  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  35.1 
 
 		 569 aa  97.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  38.96 
 
 		 519 aa  97.1  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  35.35 
 
 		 371 aa  96.3  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  35.53 
 
 		 267 aa  94  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  32.6 
 
 		 541 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  33.33 
 
 		 358 aa  93.2  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0404  rhomboid family protein  29.17 
 
 		 225 aa  92.4  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.613435  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  34.36 
 
 		 376 aa  92.4  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  34.95 
 
 		 303 aa  92.4  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  37.86 
 
 		 303 aa  91.7  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  33.51 
 
 		 348 aa  91.7  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  31.28 
 
 		 554 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  36.08 
 
 		 268 aa  90.5  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  37.14 
 
 		 303 aa  89.7  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  34.56 
 
 		 224 aa  88.2  9e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  29.28 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  29.28 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  37.8 
 
 		 511 aa  87.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  31.18 
 
 		 223 aa  85.9  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  37.41 
 
 		 190 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  35.2 
 
 		 198 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  34.69 
 
 		 198 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  31.07 
 
 		 365 aa  85.1  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  35.37 
 
 		 182 aa  84.7  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9252  predicted protein  32.74 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00301456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  32.28 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_5543  predicted protein  34.04 
 
 		 141 aa  84.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0202221  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  32.68 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  45.16 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  35.97 
 
 		 547 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  35.97 
 
 		 541 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15482  predicted protein  33.54 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  39.55 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  36.84 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  31.75 
 
 		 342 aa  82  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  33.57 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42439  predicted protein  35.16 
 
 		 570 aa  81.3  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00659721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  37.69 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  37.59 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  32.7 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  37.69 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42743  predicted protein  34.34 
 
 		 669 aa  80.1  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  37.59 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1000  rhomboid family protein  36.47 
 
 		 528 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  31.87 
 
 		 396 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  35.57 
 
 		 360 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  35.46 
 
 		 298 aa  78.6  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1449  Rhomboid family protein  36.43 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6312  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  32.04 
 
 		 625 aa  78.6  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2212  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00605445  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3291  rhomboid family protein  39.58 
 
 		 525 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  33.52 
 
 		 302 aa  78.2  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  35.05 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  33.71 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  32.6 
 
 		 625 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.6 
 
 		 625 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  35.96 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  33.57 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3194  rhomboid family protein  35.59 
 
 		 520 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  32.6 
 
 		 625 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  32.82 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0829  rhomboid family protein  35.03 
 
 		 520 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.186643  normal  0.166239 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0591  peptidase, S54 (rhomboid) family  30.94 
 
 		 625 aa  75.5  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  34.44 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5062  rhomboid family protein  35.97 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  34.44 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  36.55 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  30.43 
 
 		 291 aa  75.1  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  35.04 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  34.44 
 
 		 513 aa  74.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  31.64 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  28.18 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2194  rhomboid family protein  32.1 
 
 		 489 aa  73.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  30.17 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  33.71 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00720  uncharacterized membrane protein  31.58 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0264  rhomboid family protein  34.69 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.886981  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  32.85 
 
 		 381 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  33.95 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  34.87 
 
 		 283 aa  72  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  34.19 
 
 		 579 aa  71.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  33.09 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  32.58 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  33.1 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>