194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1193 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  428  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 205 aa  104  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 205 aa  101  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 205 aa  101  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 200 aa  99.8  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 190 aa  97.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  26.57 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  28.08 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1327  transcriptional regulator  27.38 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.043408  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  27.38 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  26.18 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  25 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  27.01 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  27.65 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  26.53 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  24.46 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  24.24 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 179 aa  62  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 181 aa  62  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  26.53 
 
 		 184 aa  62  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  23.83 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0905  putative transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  27.81 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  39.44 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3329  TetR family transcriptional regulator  22.49 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0147538 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03830  transcriptional regulator, tetR family  21.51 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  23.98 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  25.14 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1094  transcriptional regulator, TetR family  20.4 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 184 aa  52  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2292  hypothetical protein  25.47 
 
 		 155 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861673  hitchhiker  1.17922e-24 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00570  transcriptional regulator, tetR family  42.19 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  24.84 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  25.99 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0079  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0990564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  20.79 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1710  hypothetical protein  24.73 
 
 		 289 aa  50.1  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5054  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0247  transcriptional regulator, putative  25.71 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4295  hypothetical protein  26.06 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  34.78 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>