More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1176 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1176  guanylate kinase  100 
 
 		 206 aa  425  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000749098  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0313  guanylate kinase  65.53 
 
 		 209 aa  278  3e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0875391  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  65.52 
 
 		 205 aa  275  3e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1398  guanylate kinase  64.04 
 
 		 209 aa  274  7e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115166  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1713  guanylate kinase  66.84 
 
 		 198 aa  273  2.0000000000000002e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.463283  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  59.9 
 
 		 204 aa  251  6e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  58.5 
 
 		 205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0758  guanylate kinase  59.2 
 
 		 204 aa  243  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183217  hitchhiker  0.0000103593 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1231  guanylate kinase  59.18 
 
 		 198 aa  238  2.9999999999999997e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.726797  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0776  guanylate kinase  56.37 
 
 		 207 aa  238  4e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1293  guanylate kinase  57.14 
 
 		 207 aa  236  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1268  guanylate kinase  57.14 
 
 		 207 aa  236  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33638  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2523  guanylate kinase  59.3 
 
 		 205 aa  224  7e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3914  guanylate kinase  59.8 
 
 		 214 aa  222  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3722  guanylate kinase  59.8 
 
 		 205 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3612  guanylate kinase  59.8 
 
 		 214 aa  222  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3630  guanylate kinase  59.8 
 
 		 214 aa  222  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4009  guanylate kinase  59.8 
 
 		 205 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1273  guanylate kinase  59.3 
 
 		 205 aa  222  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.213463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3970  guanylate kinase  59.3 
 
 		 205 aa  223  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0125676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3885  guanylate kinase  59.8 
 
 		 205 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000575833 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3919  guanylate kinase  59.8 
 
 		 205 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.364605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3694  guanylate kinase  59.3 
 
 		 205 aa  221  6e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  53.97 
 
 		 200 aa  211  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  51.58 
 
 		 200 aa  209  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  50.76 
 
 		 216 aa  204  6e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  50.76 
 
 		 216 aa  204  6e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  50.76 
 
 		 207 aa  204  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2093  guanylate kinase  50 
 
 		 223 aa  204  8e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.353708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  48.29 
 
 		 204 aa  204  9e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1315  guanylate kinase  47.92 
 
 		 203 aa  201  7e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.559001  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1791  guanylate kinase  47.4 
 
 		 201 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395222  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl195  guanylate kinase  50.25 
 
 		 297 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0722226  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  51.34 
 
 		 194 aa  197  7.999999999999999e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  52.13 
 
 		 199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2318  guanylate kinase  48.68 
 
 		 198 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000195285  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1319  guanylate kinase  51.05 
 
 		 224 aa  191  8e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773987  normal  0.110661 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0208  guanylate kinase  50.81 
 
 		 297 aa  185  4e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  47.62 
 
 		 202 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  46.43 
 
 		 195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  46.73 
 
 		 197 aa  178  4.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0207  guanylate kinase  49.19 
 
 		 190 aa  178  5.999999999999999e-44  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.931421  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3213  guanylate kinase  45.36 
 
 		 202 aa  177  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000935163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  45.36 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  48.35 
 
 		 191 aa  176  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  46.49 
 
 		 184 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  45.03 
 
 		 211 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  45.95 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  47.62 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  41.87 
 
 		 207 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  42.56 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  41.87 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  44.62 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  44.62 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  44.62 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  44.62 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  44.62 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  44.62 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  44.62 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0840  guanylate kinase  45.69 
 
 		 202 aa  171  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  44.62 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  41.87 
 
 		 207 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  45.23 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  40.89 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  45.81 
 
 		 188 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  44.62 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  42.08 
 
 		 203 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  44.62 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  44.62 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  42.63 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  44.62 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  45.36 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2284  guanylate kinase  44.44 
 
 		 242 aa  169  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.429726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  44.62 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  44.62 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  44.72 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0577  guanylate kinase  42.5 
 
 		 204 aa  169  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.213259  normal  0.177715 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  45.51 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  43.52 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  45.25 
 
 		 184 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  47.83 
 
 		 201 aa  169  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  42.79 
 
 		 213 aa  168  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  46.56 
 
 		 212 aa  169  4e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  44.1 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0467  guanylate kinase  45.41 
 
 		 184 aa  168  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  45.95 
 
 		 184 aa  168  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2975  guanylate kinase  43.28 
 
 		 204 aa  167  7e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  42.36 
 
 		 207 aa  167  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  40.89 
 
 		 210 aa  167  8e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  40.89 
 
 		 210 aa  167  8e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  40.89 
 
 		 210 aa  167  8e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  41.24 
 
 		 212 aa  167  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  40.91 
 
 		 210 aa  167  9e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1529  guanylate kinase  41.05 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.2579 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  42.7 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4176  guanylate kinase  45.13 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0297777  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0045  guanylate kinase  45.13 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  42.08 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  44.1 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  42.55 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.57704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>