More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1160 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1160  acyl carrier protein  100 
 
 
84 aa  161  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000195346  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  63.51 
 
 
85 aa  100  8e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0538  acyl carrier protein  55.84 
 
 
82 aa  83.6  8e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.633941  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  48.68 
 
 
81 aa  83.2  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  52 
 
 
79 aa  78.2  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  52 
 
 
78 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  53.52 
 
 
77 aa  73.6  0.0000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  52.11 
 
 
77 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  52.11 
 
 
77 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  48.72 
 
 
83 aa  71.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  46.58 
 
 
78 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  48.68 
 
 
77 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  47.22 
 
 
76 aa  69.7  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  48.61 
 
 
77 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  47.14 
 
 
77 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  44.44 
 
 
82 aa  68.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0451  Acyl carrier protein  45.57 
 
 
84 aa  68.6  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3673  acyl carrier protein  45.21 
 
 
77 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173328  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3949  acyl carrier protein  43.84 
 
 
77 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.457007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  45.95 
 
 
77 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3892  acyl carrier protein  43.84 
 
 
77 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3701  acyl carrier protein  43.84 
 
 
77 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3591  acyl carrier protein  43.84 
 
 
77 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3609  acyl carrier protein  43.84 
 
 
77 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3988  acyl carrier protein  43.84 
 
 
77 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.168963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1294  acyl carrier protein  43.84 
 
 
77 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0897377  hitchhiker  0.00000000000000136256 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3864  acyl carrier protein  43.84 
 
 
77 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3997e-48 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3898  acyl carrier protein  43.84 
 
 
77 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000161668  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  45.95 
 
 
77 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2502  acyl carrier protein  43.84 
 
 
77 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000438987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  44.74 
 
 
77 aa  67  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  47.3 
 
 
77 aa  67  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  42.47 
 
 
81 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  42.47 
 
 
81 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  37.18 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0949  acyl carrier protein  46.15 
 
 
79 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000253013  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  43.24 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  43.42 
 
 
77 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  48.53 
 
 
77 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  65.1  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  45.21 
 
 
79 aa  65.1  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0452  acyl carrier protein  49.25 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  44 
 
 
79 aa  65.1  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  45.21 
 
 
80 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  42.67 
 
 
79 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  42.67 
 
 
79 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  45.21 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1548  Acyl carrier protein (ACP)  43.06 
 
 
77 aa  64.3  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.079585  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  45.33 
 
 
80 aa  63.9  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  42.67 
 
 
79 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  45.21 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  42.67 
 
 
79 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  42.67 
 
 
79 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  42.67 
 
 
79 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  46.38 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  46.38 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  46.38 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  40.51 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  46.38 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  46.38 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  46.48 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  46.38 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  46.38 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  46.38 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  46.38 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  46.38 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  46.38 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  46.38 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  46.38 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  46.38 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  46.38 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  46.38 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  46.38 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  46.38 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  45.07 
 
 
79 aa  63.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  44 
 
 
80 aa  63.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  44 
 
 
80 aa  63.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  42.67 
 
 
79 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0918  acyl carrier protein  45.71 
 
 
79 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150298  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3647  acyl carrier protein  45.57 
 
 
84 aa  62.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742845  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  44 
 
 
80 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  44.59 
 
 
79 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  42.67 
 
 
78 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0983  acyl carrier protein  45.71 
 
 
79 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415355  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  45.71 
 
 
76 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  43.66 
 
 
77 aa  62.8  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1873  acyl carrier protein  44 
 
 
78 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107725  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  46.38 
 
 
79 aa  62  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  40 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  46.38 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  45.71 
 
 
77 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  42.47 
 
 
84 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  46.38 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  42.47 
 
 
80 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0196  acyl carrier protein  44.44 
 
 
79 aa  61.6  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  44 
 
 
80 aa  62  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  42.11 
 
 
79 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  44.29 
 
 
74 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  40.26 
 
 
79 aa  61.6  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  42.11 
 
 
79 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>