More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1155 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  67.01 
 
 
491 aa  666    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  100 
 
 
481 aa  968    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  65.11 
 
 
507 aa  617  1e-175  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  64.33 
 
 
476 aa  612  9.999999999999999e-175  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  62.08 
 
 
520 aa  576  1.0000000000000001e-163  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  61.4 
 
 
521 aa  570  1e-161  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  60.44 
 
 
455 aa  562  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  60.44 
 
 
455 aa  562  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1725  signal recognition particle protein  60.66 
 
 
518 aa  562  1.0000000000000001e-159  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.862121  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  59.56 
 
 
455 aa  555  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  59.23 
 
 
449 aa  536  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  59.23 
 
 
449 aa  536  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  59.45 
 
 
449 aa  537  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  59.23 
 
 
449 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  59.45 
 
 
449 aa  537  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  59.45 
 
 
449 aa  537  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  59.45 
 
 
449 aa  537  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  59.23 
 
 
449 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  59.45 
 
 
449 aa  537  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  59 
 
 
449 aa  532  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  59 
 
 
449 aa  534  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  60.24 
 
 
469 aa  529  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  61.11 
 
 
446 aa  525  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  59.29 
 
 
447 aa  501  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  55.7 
 
 
449 aa  498  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  56.72 
 
 
444 aa  497  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  56.71 
 
 
446 aa  498  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  57.79 
 
 
446 aa  488  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  58.1 
 
 
445 aa  486  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  56.43 
 
 
448 aa  481  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  55.22 
 
 
446 aa  481  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  51.98 
 
 
479 aa  481  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  54.55 
 
 
452 aa  479  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  54.55 
 
 
452 aa  479  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  55.84 
 
 
445 aa  479  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  54.86 
 
 
448 aa  479  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  53.76 
 
 
443 aa  480  1e-134  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  55.27 
 
 
453 aa  477  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  53.12 
 
 
443 aa  473  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.2 
 
 
447 aa  473  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  50.57 
 
 
441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  52.99 
 
 
446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  53.95 
 
 
450 aa  467  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  53.11 
 
 
442 aa  466  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  53.98 
 
 
454 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  50.88 
 
 
450 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  55.12 
 
 
453 aa  465  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  52.46 
 
 
451 aa  462  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.77 
 
 
452 aa  463  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  52.2 
 
 
444 aa  463  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  51.48 
 
 
447 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.08 
 
 
512 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  56.68 
 
 
452 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  52.55 
 
 
452 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.95 
 
 
490 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  50.68 
 
 
449 aa  457  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  52.91 
 
 
444 aa  451  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  50.8 
 
 
492 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  52.01 
 
 
449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  52.35 
 
 
512 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  50.93 
 
 
443 aa  451  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  52.19 
 
 
518 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  50.59 
 
 
493 aa  449  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2535  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.92 
 
 
483 aa  450  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00293209  normal  0.012093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  52.62 
 
 
454 aa  450  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  52.62 
 
 
454 aa  450  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  50.67 
 
 
508 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  50.56 
 
 
445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  51.98 
 
 
444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  50.81 
 
 
485 aa  443  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1050  signal recognition particle GTPase  51.46 
 
 
544 aa  442  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  52.2 
 
 
463 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  49.78 
 
 
441 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1825  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (SRP54)  52.66 
 
 
516 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  51.25 
 
 
451 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  51.86 
 
 
488 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.7 
 
 
443 aa  439  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  50.84 
 
 
450 aa  440  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  50.45 
 
 
517 aa  441  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1862  signal recognition particle protein  50.59 
 
 
444 aa  440  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000295764  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05915  signal recognition particle protein  51.07 
 
 
442 aa  439  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.414308  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  53.13 
 
 
453 aa  436  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  50 
 
 
440 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1771  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.21 
 
 
496 aa  437  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.01 
 
 
454 aa  436  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.53 
 
 
443 aa  437  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.8 
 
 
515 aa  437  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.955104 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0328  signal recognition particle protein  51.24 
 
 
556 aa  437  1e-121  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.59605 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.03 
 
 
449 aa  435  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  50.46 
 
 
449 aa  437  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0572  signal recognition particle protein  50.59 
 
 
492 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3424  signal recognition particle protein  51.73 
 
 
524 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  52.9 
 
 
453 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5930  signal recognition particle protein  49.56 
 
 
518 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.411186  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  50.68 
 
 
522 aa  434  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1563  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.77 
 
 
551 aa  433  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.333794  normal  0.0756555 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  50.23 
 
 
449 aa  432  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.47 
 
 
478 aa  434  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000697976 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4020  signal recognition particle protein  48.73 
 
 
489 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000574509 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.79 
 
 
527 aa  431  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645209  normal  0.354043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>