More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1115 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  100 
 
 		 243 aa  489  1e-137  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  42.02 
 
 		 229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  49.11 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  43.56 
 
 		 243 aa  155  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  43.12 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  43.9 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  43.41 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  39.66 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  39.66 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  49.37 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  43.43 
 
 		 247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  35.22 
 
 		 280 aa  128  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  50.67 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  42.21 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  47.34 
 
 		 226 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  45.8 
 
 		 247 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  48.12 
 
 		 361 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  45.8 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  39.75 
 
 		 671 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  40.38 
 
 		 640 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  39.75 
 
 		 668 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  41.83 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  40.38 
 
 		 669 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  37.11 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  45.04 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  39.62 
 
 		 216 aa  111  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  39.61 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  39.61 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  39.87 
 
 		 689 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  34.76 
 
 		 620 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  31.39 
 
 		 651 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  31.39 
 
 		 651 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  31.39 
 
 		 1156 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  42.4 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  36.75 
 
 		 652 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  35.71 
 
 		 280 aa  101  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  36.75 
 
 		 230 aa  101  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1484  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  44.37 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  37.33 
 
 		 365 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  32.8 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  37.42 
 
 		 280 aa  99.4  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  40.61 
 
 		 281 aa  99.4  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  39.42 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  32.51 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  33.33 
 
 		 683 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  37.58 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  35.44 
 
 		 684 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  35.44 
 
 		 684 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  29.72 
 
 		 282 aa  95.9  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  32.74 
 
 		 237 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  36.94 
 
 		 251 aa  95.5  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  36.21 
 
 		 257 aa  95.5  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  36.94 
 
 		 251 aa  95.5  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  36.21 
 
 		 257 aa  95.5  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  33.33 
 
 		 282 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  40.65 
 
 		 284 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  35.62 
 
 		 564 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  39.23 
 
 		 351 aa  92  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  32.54 
 
 		 688 aa  85.5  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1205  peptidase S14, ClpP  41.12 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0522889  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  38.75 
 
 		 684 aa  82  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  29.72 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  30.26 
 
 		 656 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  29.86 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  30.38 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  39.37 
 
 		 641 aa  78.6  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  36.05 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  36.05 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  30.63 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  32.52 
 
 		 381 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  35.71 
 
 		 667 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  35.88 
 
 		 674 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1304  peptidase S14 ClpP  35.44 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  26.41 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2151  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.08 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2808  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  28.89 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0596044  normal  0.977221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5772  peptidase S14 ClpP  34.62 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09880  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  30.63 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.860863  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7291  Endopeptidase Clp  29.33 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.800235 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14387  predicted protein  29.73 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.209543  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3132  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  29.37 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2405  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14 / ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  29.93 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0397607  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0715  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.71 
 
 		 196 aa  57  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1519  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.06 
 
 		 198 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4896  Endopeptidase Clp  30.97 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3244  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.12 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2806  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.36 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.312252  decreased coverage  0.00941444 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86088  mitochondrial Clp protease, subunit of ClpP peptidase complex  30.92 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.207682  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2159  Endopeptidase Clp  29.2 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04370  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 2  27.41 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1109  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.15 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.42074  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2407  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  27.74 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1068  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.15 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3878  endopeptidase Clp  27.33 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.182477  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2206  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.41 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0202  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.12 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.211478  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2184  endopeptidase Clp  30.15 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.604475  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0691  Endopeptidase Clp  28.68 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.238496  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1656  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.57 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517527  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3324  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.27 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.09384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>