More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0995 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0995  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 203 aa  427  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000156889  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1592  integrase catalytic subunit  98.02 
 
 		 464 aa  419  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2415  transposase  40 
 
 		 287 aa  150  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  39.49 
 
 		 283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  39.49 
 
 		 283 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.274968 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  39.49 
 
 		 283 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  39.49 
 
 		 283 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  39.49 
 
 		 283 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  39.49 
 
 		 283 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  39.49 
 
 		 283 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  39.49 
 
 		 283 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  39.49 
 
 		 283 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  39.49 
 
 		 283 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  39.49 
 
 		 283 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  39.49 
 
 		 283 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0124  ISPsy8, transposase OrfB  39.09 
 
 		 259 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0450  ISPsy8, transposase OrfB  39.09 
 
 		 259 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0516  ISPsy8, transposase OrfB  39.09 
 
 		 259 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5509  ISPsy8, transposase OrfB  39.09 
 
 		 259 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5066  ISPsy8, transposase OrfB  39.09 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  39.09 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  39.09 
 
 		 268 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  39.09 
 
 		 268 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  39.09 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2945  Integrase catalytic region  38.19 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0817746  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3208  Integrase catalytic region  38.19 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0974  Integrase catalytic region  38.19 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382547  normal  0.109209 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3620  transposase  38.58 
 
 		 265 aa  141  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0498053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3662  integrase core domain protein  38.58 
 
 		 265 aa  141  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0307  transposase orfB, IS150-related  38.07 
 
 		 269 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0416  transposase  39.41 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0878674  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C34  transposase  38.92 
 
 		 298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1788  IS3 family transposase  41.08 
 
 		 261 aa  138  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2727  integrase catalytic region  38.66 
 
 		 248 aa  137  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2397  integrase catalytic region  38.66 
 
 		 248 aa  138  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.861552 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3346  integrase catalytic region  38.66 
 
 		 248 aa  138  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0096806 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4456  integrase catalytic region  38.66 
 
 		 248 aa  138  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1458  integrase catalytic region  38.66 
 
 		 248 aa  138  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31397  normal  0.395934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1740  integrase catalytic region  38.66 
 
 		 248 aa  138  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  hitchhiker  0.000236948 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3912  integrase catalytic region  38.66 
 
 		 248 aa  138  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553017  normal  0.660901 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2938  integrase catalytic region  38.66 
 
 		 248 aa  138  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0006  IS3 family transposase  41.08 
 
 		 261 aa  137  8.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149374 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1459  IS3 family transposase  41.08 
 
 		 261 aa  137  8.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000914872  normal  0.0630219 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0662  transposase  38.92 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1670  transposase  38.92 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  38.61 
 
 		 278 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  38.61 
 
 		 278 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05860  transposase  36.1 
 
 		 283 aa  136  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0882  transposase  37.93 
 
 		 272 aa  136  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1035  transposase  37.93 
 
 		 273 aa  136  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0448539  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1085  transposase  37.93 
 
 		 273 aa  136  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0405  Integrase catalytic region  35.12 
 
 		 272 aa  135  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0876667  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1068  IS861, transposase OrfB  37.81 
 
 		 277 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1527  IS861, transposase OrfB  37.81 
 
 		 277 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1125  Integrase catalytic region  35.61 
 
 		 284 aa  135  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0947963  hitchhiker  0.00000135034 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2913  Integrase catalytic region  35.61 
 
 		 284 aa  135  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0026  transposase  36.82 
 
 		 269 aa  135  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0905  Integrase catalytic region  33.65 
 
 		 266 aa  134  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000083708  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1584  Integrase catalytic region  33.65 
 
 		 266 aa  134  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1163  Integrase catalytic region  33.65 
 
 		 266 aa  134  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1378  Integrase catalytic region  33.65 
 
 		 266 aa  134  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1573  Integrase catalytic region  33.65 
 
 		 266 aa  134  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2154  Integrase catalytic region  33.65 
 
 		 266 aa  134  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1209  Integrase catalytic region  33.65 
 
 		 266 aa  134  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1595  Integrase catalytic region  33.65 
 
 		 266 aa  134  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0208  Integrase catalytic region  33.65 
 
 		 266 aa  134  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2371  Integrase catalytic region  33.65 
 
 		 266 aa  134  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0273  integrase catalytic subunit  37.37 
 
 		 278 aa  134  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0592  integrase catalytic subunit  37.37 
 
 		 278 aa  134  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398355  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1176  integrase catalytic subunit  37.37 
 
 		 278 aa  134  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.155999  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4616  integrase catalytic subunit  37.37 
 
 		 278 aa  134  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.698457  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4680  integrase catalytic subunit  37.37 
 
 		 278 aa  134  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0908  integrase core subunit  38.59 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3804  integrase core subunit  38.59 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4172  integrase core subunit  38.59 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3998  integrase core subunit  38.59 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3902  integrase core subunit  38.59 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0196  integrase core subunit  38.59 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0350068 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3759  integrase core subunit  38.59 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3122  integrase core subunit  38.59 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00391606  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5018  ISPsy9, transposase OrfB  37.37 
 
 		 278 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14520  transposase  35.86 
 
 		 283 aa  132  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  37.25 
 
 		 279 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  37.25 
 
 		 279 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4363  transposase  36.04 
 
 		 215 aa  132  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267789  hitchhiker  2.99756e-22 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  37.25 
 
 		 279 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  37.25 
 
 		 279 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1714  transposase  38.24 
 
 		 278 aa  131  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  36.04 
 
 		 270 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  36.04 
 
 		 270 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  36.04 
 
 		 270 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0717  integrase catalytic subunit  39.22 
 
 		 261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.558663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0848  integrase catalytic subunit  39.22 
 
 		 261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1577  integrase catalytic subunit  39.22 
 
 		 261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.279406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2077  integrase catalytic subunit  39.22 
 
 		 261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.74373  normal  0.201044 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2412  integrase catalytic subunit  39.22 
 
 		 261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.714231 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2437  integrase catalytic subunit  39.22 
 
 		 261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  36.04 
 
 		 278 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  35.78 
 
 		 267 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0109  IS3-family transposase, OrfB  35.78 
 
 		 249 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0514465  hitchhiker  0.00000245789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>