More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0947 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0947  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 462 aa  906    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000410718  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  39.52 
 
 		 465 aa  330  5.0000000000000004e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.75 
 
 		 561 aa  249  6e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.91 
 
 		 479 aa  247  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.91 
 
 		 479 aa  247  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1519  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.3 
 
 		 502 aa  247  3e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  31.08 
 
 		 496 aa  246  8e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.04 
 
 		 513 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.04 
 
 		 513 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.04 
 
 		 492 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.79 
 
 		 492 aa  240  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  35.04 
 
 		 492 aa  240  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  35.04 
 
 		 492 aa  240  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  32.26 
 
 		 490 aa  239  5.999999999999999e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.79 
 
 		 492 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.55 
 
 		 492 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.55 
 
 		 492 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.79 
 
 		 492 aa  237  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.75 
 
 		 635 aa  237  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3194  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.794509  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2739  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.38 
 
 		 482 aa  233  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.24 
 
 		 570 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.82 
 
 		 564 aa  230  5e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.63 
 
 		 658 aa  228  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22510  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.09 
 
 		 494 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0949  permease, general substrate transporter  34.24 
 
 		 482 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000025972  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0971  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.24 
 
 		 482 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0959  permease, general substrate transporter  34.24 
 
 		 482 aa  225  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0281229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1038  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.24 
 
 		 482 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2340  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.57 
 
 		 472 aa  223  4e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1116  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.99 
 
 		 482 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000271146 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.4 
 
 		 579 aa  221  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.57 
 
 		 657 aa  219  7e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.43 
 
 		 599 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 479 aa  213  5.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  30.85 
 
 		 599 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  30.85 
 
 		 683 aa  212  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.95 
 
 		 599 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.85 
 
 		 599 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  30.85 
 
 		 599 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.85 
 
 		 599 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.85 
 
 		 599 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.85 
 
 		 599 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.85 
 
 		 599 aa  211  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 597 aa  211  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2376  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.58 
 
 		 643 aa  208  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1880  major facilitator superfamily permease  30.28 
 
 		 503 aa  208  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2422  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.58 
 
 		 643 aa  208  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.845412  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2198  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.55 
 
 		 481 aa  206  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0460557  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2236  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.55 
 
 		 481 aa  206  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.126562  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0268  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.08 
 
 		 500 aa  204  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0312698  decreased coverage  0.00157172 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1468  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.58 
 
 		 491 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.986472  normal  0.151461 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0734  lincomycin resistance protein  31.83 
 
 		 480 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.498733  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1003  lincomycin resistance protein LmrB  31.58 
 
 		 480 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.21 
 
 		 579 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1378  major facilitator superfamily permease  33.26 
 
 		 512 aa  196  5.000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0602023  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1707  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.42 
 
 		 499 aa  192  9e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00395265  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1318  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 465 aa  191  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06270  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.95 
 
 		 490 aa  189  8e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.6 
 
 		 620 aa  187  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.892029  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 534 aa  186  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1459  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.81 
 
 		 483 aa  186  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257317  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.04 
 
 		 514 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.51 
 
 		 490 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0161  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.67 
 
 		 494 aa  185  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.99 
 
 		 524 aa  184  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05820  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.81 
 
 		 510 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.39 
 
 		 523 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30030  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.91 
 
 		 487 aa  180  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00171806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1383  major facilitator superfamily permease  30.59 
 
 		 519 aa  179  9e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.601618  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.89 
 
 		 483 aa  178  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2424  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.69 
 
 		 496 aa  178  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.88 
 
 		 558 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2667  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.11 
 
 		 485 aa  177  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0905281  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23660  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.44 
 
 		 461 aa  177  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.629317  normal  0.503051 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.26 
 
 		 510 aa  177  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.05 
 
 		 500 aa  176  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000893352  hitchhiker  0.00471574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.57 
 
 		 491 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0888  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.64 
 
 		 486 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.64 
 
 		 486 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0290  major facilitator superfamily permease  30 
 
 		 463 aa  174  3.9999999999999995e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.146864  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1423  major facilitator superfamily permease  29.34 
 
 		 464 aa  172  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.904673  hitchhiker  0.0000661431 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.25 
 
 		 501 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2675  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.94 
 
 		 482 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.97 
 
 		 492 aa  171  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013721  HMPREF0424_0354  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-2 (14 Spanner) (DHA2) family protein  27.17 
 
 		 542 aa  170  4e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008528  OEOE_1853  major facilitator superfamily permease  29.23 
 
 		 471 aa  170  6e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_02600  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.77 
 
 		 505 aa  168  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013204  Elen_2756  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.66 
 
 		 471 aa  167  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_0845  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.79 
 
 		 489 aa  167  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222515  normal  0.167552 
 
 
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NC_008528  OEOE_0097  major facilitator superfamily permease  28.85 
 
 		 493 aa  166  8e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000342925  n/a   
 
 
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NC_009513  Lreu_0360  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 461 aa  166  9e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A1115  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.79 
 
 		 491 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.92 
 
 		 491 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_1028  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.92 
 
 		 491 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10576e-22 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B4325  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.92 
 
 		 491 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0988  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.92 
 
 		 491 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010816  BLD_0998  putative permease  27.21 
 
 		 548 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.33 
 
 		 545 aa  163  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
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NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.89 
 
 		 479 aa  162  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal  1 
 
 
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