More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0916 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0916  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  100 
 
 		 954 aa  1959    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1030  Rad3-related DNA helicase  33.37 
 
 		 937 aa  476  1e-133  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0174435  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.06 
 
 		 934 aa  430  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.15 
 
 		 934 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.84 
 
 		 934 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.58 
 
 		 934 aa  432  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.15 
 
 		 934 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.31 
 
 		 934 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.28 
 
 		 934 aa  431  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.1 
 
 		 929 aa  429  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.38 
 
 		 934 aa  423  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.38 
 
 		 934 aa  424  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.38 
 
 		 934 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.07 
 
 		 921 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.1 
 
 		 930 aa  324  4e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  38.19 
 
 		 909 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.62 
 
 		 944 aa  299  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  27.12 
 
 		 929 aa  296  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.99 
 
 		 921 aa  296  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.41 
 
 		 956 aa  295  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.77 
 
 		 952 aa  291  5.0000000000000004e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1514  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  27.16 
 
 		 897 aa  272  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.103927  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1543  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  27.16 
 
 		 897 aa  272  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.959984  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1025  DNA polymerase III, epsilon subunit/ATP-dependent helicase DinG  27.38 
 
 		 902 aa  267  7e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1384  Rad3-related DNA helicase  37.56 
 
 		 797 aa  256  1.0000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.63 
 
 		 957 aa  253  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2024  Rad3-related DNA helicase  33.84 
 
 		 791 aa  251  3e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0524  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.04 
 
 		 835 aa  225  3e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00517102  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  26.56 
 
 		 651 aa  206  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  25.47 
 
 		 822 aa  206  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  24.18 
 
 		 659 aa  204  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  27.19 
 
 		 660 aa  199  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  27.06 
 
 		 725 aa  198  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  26.23 
 
 		 851 aa  197  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2877  helicase c2  27.57 
 
 		 658 aa  196  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  26.67 
 
 		 681 aa  194  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  26.55 
 
 		 743 aa  187  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  26.93 
 
 		 640 aa  187  7e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  24.96 
 
 		 668 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  26 
 
 		 876 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  26.01 
 
 		 838 aa  183  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  26.3 
 
 		 649 aa  183  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  27.77 
 
 		 636 aa  181  4e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  25.11 
 
 		 843 aa  181  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  25.46 
 
 		 840 aa  179  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  25.22 
 
 		 709 aa  177  8e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  28.06 
 
 		 659 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  22.51 
 
 		 832 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  26.48 
 
 		 658 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0239  helicase c2  28.41 
 
 		 664 aa  173  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  27.14 
 
 		 640 aa  173  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1446  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.73 
 
 		 703 aa  170  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  25.32 
 
 		 843 aa  170  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  25.86 
 
 		 830 aa  169  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1099  Rad3-related DNA helicase  32.02 
 
 		 489 aa  169  2.9999999999999998e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.829267  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  25.37 
 
 		 643 aa  167  9e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.34 
 
 		 694 aa  167  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3486  helicase c2  24.3 
 
 		 698 aa  167  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.4 
 
 		 921 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  25.07 
 
 		 691 aa  164  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.46 
 
 		 690 aa  163  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.95 
 
 		 934 aa  162  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  25.14 
 
 		 757 aa  162  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.39 
 
 		 712 aa  162  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2316  helicase c2  25.29 
 
 		 670 aa  162  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2094  helicase c2  25.69 
 
 		 673 aa  161  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.239782  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1624  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.42 
 
 		 721 aa  160  9e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.25 
 
 		 927 aa  159  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50840  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.28 
 
 		 714 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4334  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.35 
 
 		 714 aa  159  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.044641  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  27.17 
 
 		 684 aa  159  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.99 
 
 		 691 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3112  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.04 
 
 		 966 aa  156  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000116759  hitchhiker  0.000000000648685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1427  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.9 
 
 		 714 aa  157  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.26 
 
 		 690 aa  156  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.26 
 
 		 690 aa  156  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.26 
 
 		 690 aa  156  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.26 
 
 		 690 aa  156  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  23.96 
 
 		 667 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  22.77 
 
 		 647 aa  154  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.81 
 
 		 692 aa  152  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  34.48 
 
 		 636 aa  150  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1146  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.13 
 
 		 714 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.980909  normal  0.730569 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  29.39 
 
 		 661 aa  149  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.02 
 
 		 692 aa  148  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4290  ATP-dependent DNA helicase DinG  25 
 
 		 714 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.76 
 
 		 960 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1125  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.87 
 
 		 714 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437588  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1161  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.87 
 
 		 714 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0350  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.71 
 
 		 711 aa  147  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00468076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  30.4 
 
 		 729 aa  146  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19450  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.33 
 
 		 714 aa  145  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1225  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.38 
 
 		 714 aa  145  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  33.1 
 
 		 713 aa  144  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  32.98 
 
 		 725 aa  143  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3856  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.68 
 
 		 714 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160495  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  35.27 
 
 		 653 aa  142  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28440  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  27.02 
 
 		 986 aa  141  4.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32018  normal  0.0233138 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1132  hypothetical protein  34.25 
 
 		 681 aa  141  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4120  ATP-dependent helicase, DinG family  23.54 
 
 		 714 aa  141  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>