More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0909 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0909  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 339 aa  699    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000295634  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0881  LacI family transcription regulator  31.75 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000659595  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1547  LacI family transcription regulator  30.5 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0111532  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1340  LacI family transcription regulator  30.21 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000460933  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2079  transcriptional regulator, LacI family  32.06 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275805  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0714  transcriptional regulator, LacI family  28.78 
 
 		 334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0539  transcriptional regulator, LacI family  31.09 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0793  transcriptional regulator, LacI family  28.95 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.137474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0625  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  27.43 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3257  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  27.43 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3369  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  27.73 
 
 		 327 aa  136  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02944  DNA-binding transcriptional repressor  27.43 
 
 		 327 aa  135  8e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0626  transcriptional regulator, LacI family  27.43 
 
 		 327 aa  135  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3542  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  27.43 
 
 		 327 aa  135  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02894  hypothetical protein  27.43 
 
 		 327 aa  135  8e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4389  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  27.43 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002659  beta-D-galactosidase transcriptional repressor  29.41 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.443693  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1972  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  28.12 
 
 		 326 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0103522 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03334  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  29.03 
 
 		 328 aa  132  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0302  LacI family transcription regulator  28.49 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.323775  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1087  LacI family transcription regulator  28.95 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.42902  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1372  galactose operon repressor  28.95 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1775  LacI family transcription regulator  27.47 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1063  LacI family transcription regulator  30.12 
 
 		 325 aa  116  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  29.23 
 
 		 386 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4137  regulatory protein LacI  29.78 
 
 		 359 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0568  LacI family transcription regulator  24.72 
 
 		 339 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000865309  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1323  transcription regulator of beta-galactosidase gene  26.84 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0977  transcriptional regulator, LacI family  26.48 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1949  LacR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.721622  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.93 
 
 		 336 aa  105  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  27.66 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0892  LacI family transcription regulator  25.07 
 
 		 346 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00803151  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0741  transcriptional regulator, LacI family  25.63 
 
 		 343 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 		 338 aa  103  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  29.46 
 
 		 337 aa  102  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  25.94 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.94 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1559  alanine racemase  26.65 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000066632  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  25.5 
 
 		 344 aa  99.4  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  25.36 
 
 		 328 aa  99  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0577  LacI family transcription regulator  27.7 
 
 		 344 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.868296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  24.46 
 
 		 333 aa  98.2  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0509  transcriptional regulator, LacI family  26.15 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000057395  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  27.99 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  25.91 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  25.08 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  25.08 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  24.57 
 
 		 331 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  23.64 
 
 		 330 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  25.5 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29310  transcriptional regulator  26.07 
 
 		 357 aa  96.7  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0925  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  27.7 
 
 		 337 aa  96.7  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.197996  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1193  transcriptional regulator, LacI family  27.69 
 
 		 326 aa  96.3  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.502548  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  25.08 
 
 		 332 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  23.64 
 
 		 330 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  23.64 
 
 		 330 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03639  DNA-binding transcriptional repressor of ribose metabolism  23.64 
 
 		 330 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00237415  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03584  hypothetical protein  23.64 
 
 		 330 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00148852  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1870  LacI family transcription regulator  28.35 
 
 		 342 aa  95.9  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  25.08 
 
 		 332 aa  95.9  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  23.33 
 
 		 330 aa  95.1  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1063  LacI family transcription regulator  27.42 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  26.01 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  24.34 
 
 		 341 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  25.08 
 
 		 332 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  26.16 
 
 		 341 aa  94.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  23.33 
 
 		 330 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  27.86 
 
 		 336 aa  93.6  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.78 
 
 		 330 aa  93.2  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  24.2 
 
 		 339 aa  92.8  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1363  lac repressor  26.65 
 
 		 358 aa  92.8  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3187  LacI family transcription regulator  26.44 
 
 		 337 aa  92.4  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  26.32 
 
 		 332 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  26.32 
 
 		 332 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2606  transcriptional regulator  25.35 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  23.91 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  26.45 
 
 		 336 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  23.71 
 
 		 343 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0285  alanine racemase  28.65 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0372  transcriptional regulator, LacI family  26.67 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1520  transcriptional regulator, LacI family  25.66 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0658956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  24.06 
 
 		 338 aa  90.5  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2196  LacI family transcription regulator  27.51 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0908748  hitchhiker  0.000488625 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0177  transcriptional regulator, LacI family  26.25 
 
 		 343 aa  90.1  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  26.18 
 
 		 351 aa  89.7  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1769  lac repressor  26.91 
 
 		 358 aa  89.4  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.044739  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2960  transcriptional regulator, LacI family  24.92 
 
 		 337 aa  89.7  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.430193 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3504  transcriptional regulator, LacI family protein  24.69 
 
 		 340 aa  89.4  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0875897  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02564  DNA-binding transcriptional repressor  26.59 
 
 		 337 aa  89  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02529  hypothetical protein  26.59 
 
 		 337 aa  89  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3061  transcriptional regulator, LacI family  27.69 
 
 		 326 aa  89.4  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3266  transcriptional regulator, LacI family  23.85 
 
 		 340 aa  89.4  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.030441 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2850  transcriptional regulator AscG  26.59 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01891  putative sugar-binding protein  26.16 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0103851  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11680  transcriptional regulator  23.69 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  25.64 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3162  transcriptional regulator AscG  26.59 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2877  transcriptional regulator, LacI family  27.11 
 
 		 372 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  25.51 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>