226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0882 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 		 241 aa  487  1e-137  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0363  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  31.97 
 
 		 292 aa  139  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112983 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  34.57 
 
 		 269 aa  132  5e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  29.56 
 
 		 280 aa  95.9  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  30.96 
 
 		 278 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  30.96 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  30.96 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  30.96 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  30.96 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  26.78 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  26.61 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  27.86 
 
 		 277 aa  86.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  30.32 
 
 		 282 aa  85.9  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  30.16 
 
 		 282 aa  85.9  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0694  Ion transport 2  26.24 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  30.29 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2671  ion transporter  28.36 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0620  ion transport 2 domain-containing protein  24.38 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  26.4 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  27.19 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  28.12 
 
 		 279 aa  82  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  28.27 
 
 		 271 aa  81.6  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  23.05 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  26.17 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  26.17 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  23.05 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  26.17 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  26.17 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  23.05 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3485  Ion transport 2 domain-containing protein  24.2 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319934  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0462  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  25.73 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  26.18 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  25.24 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  23.05 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  25.46 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  27.4 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  27.4 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1581  Ion transport 2 domain-containing protein  27.78 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  27.4 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  25 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  24.6 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  28.72 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1192  Ion transport protein  26.61 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.645124  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  26.56 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  29 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  25.48 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  26.45 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  28.9 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  26.63 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  29.38 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3117  Ion transport 2 domain-containing protein  23.36 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0962789  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0855  Ion transport 2 domain-containing protein  23.36 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.289459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  28.38 
 
 		 276 aa  75.1  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  29.49 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  29.86 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  28.07 
 
 		 276 aa  75.1  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  27.5 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  26.43 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0824  Ion transport 2 domain-containing protein  22.45 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.978487 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2297  Ion transport protein  29.95 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3094  Ion transport 2 domain-containing protein  24.29 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533818  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  27.4 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  30.41 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  25.77 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0253  Ion transport 2 domain protein  26.37 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  29.14 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  27.96 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1556  Ion transport protein  27.92 
 
 		 328 aa  72.4  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000506014  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3768  ion transporter  23.46 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  29.07 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  27.75 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  23.79 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  29.14 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  25.88 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1615  Ion transport protein  24.1 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  23.27 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  28.06 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  29.05 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  24.1 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_7186  VIC family transporter: potassium ion channel  28.88 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0156441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3269  Ion transport 2 domain-containing protein  22.71 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  25.63 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.1 
 
 		 408 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1097  Ion transport 2 domain-containing protein  30.16 
 
 		 140 aa  67  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168795  normal  0.504261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  25.53 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02294  ion transporter  26.27 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  22.55 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  27.37 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  27.49 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0262  Ion transport 2 domain-containing protein  26.42 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  24.44 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  26.09 
 
 		 257 aa  65.1  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  26.47 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  27.12 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  40.21 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  29.19 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  28.44 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0773  ion transporter  27.47 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.888374  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  25.11 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  25.87 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>