53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0860 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0860  hypothetical protein  100 
 
 		 55 aa  98.2  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000565608  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0923  H+/gluconate symporter related permease  62.26 
 
 		 444 aa  68.6  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.59595  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  51.92 
 
 		 452 aa  53.9  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  51.92 
 
 		 452 aa  53.9  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3703  gluconate transporter  50.94 
 
 		 448 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.900144  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0298  gluconate transporter  45.28 
 
 		 438 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000171105  normal  0.0267385 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3891  high-affinity gluconate transporter  45.28 
 
 		 438 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3613  high-affinity gluconate transporter  45.28 
 
 		 438 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03219  hypothetical protein  45.28 
 
 		 438 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000216048  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0298  gluconate transporter  45.28 
 
 		 438 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000270945  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03267  gluconate transporter, high-affinity GNT I system  45.28 
 
 		 438 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4722  high-affinity gluconate transporter  45.28 
 
 		 438 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3696  high-affinity gluconate transporter  45.28 
 
 		 438 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.590418 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3796  high-affinity gluconate transporter  45.28 
 
 		 438 aa  51.2  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3786  high-affinity gluconate transporter  45.28 
 
 		 438 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3820  high-affinity gluconate transporter  45.28 
 
 		 438 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.832032 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3711  high-affinity gluconate transporter  45.28 
 
 		 438 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3714  high-affinity gluconate transporter  45.28 
 
 		 438 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3882  high-affinity gluconate transporter  45.28 
 
 		 438 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3828  gluconate transporter  41.51 
 
 		 438 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  33.96 
 
 		 438 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  33.96 
 
 		 438 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  33.96 
 
 		 438 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  33.96 
 
 		 438 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  33.96 
 
 		 438 aa  44.3  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  57.69 
 
 		 452 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3844  low affinity gluconate transporter  43.18 
 
 		 446 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.567934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3910  low affinity gluconate transporter  43.18 
 
 		 446 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.706016 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3741  low affinity gluconate transporter  43.18 
 
 		 446 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3730  low affinity gluconate transporter  43.18 
 
 		 446 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.811939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3808  low affinity gluconate transporter  43.18 
 
 		 446 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1892  high-affinity H+/gluconate symporter  43.75 
 
 		 437 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3850  low affinity gluconate transporter  43.18 
 
 		 446 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3914  low affinity gluconate transporter  40.91 
 
 		 446 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03287  gluconate transporter, low affinity GNT 1 system  40.91 
 
 		 446 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.805381  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03240  hypothetical protein  40.91 
 
 		 446 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0279  gluconate transporter  40.91 
 
 		 446 aa  41.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4752  low affinity gluconate transporter  40.91 
 
 		 446 aa  41.2  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.920357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5329  gluconate transporter  36.54 
 
 		 477 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3889  low affinity gluconate transporter  40.91 
 
 		 446 aa  41.2  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5418  gluconate transporter  36.54 
 
 		 477 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3719  low affinity gluconate transporter  40.91 
 
 		 446 aa  41.2  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5708  gluconate transporter  36.54 
 
 		 477 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0277  low affinity gluconate transporter  40.91 
 
 		 446 aa  41.2  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3635  low affinity gluconate transporter  40.91 
 
 		 446 aa  41.2  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2702  gluconate transporter  39.22 
 
 		 456 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0163  gluconate permease  49.06 
 
 		 448 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0156  gluconate permease  49.06 
 
 		 448 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0158  gluconate permease  49.06 
 
 		 448 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0165  gluconate permease  49.06 
 
 		 448 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0207  gluconate permease  49.06 
 
 		 448 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0185  gluconate permease  49.06 
 
 		 448 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0503  gluconate transporter  36.54 
 
 		 476 aa  40  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>