55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0739 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0739  DNA replication and repair protein RecO  100 
 
 		 261 aa  542  1e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0781  DNA replication and repair protein RecO  39.13 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.672101  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  39.68 
 
 		 257 aa  195  6e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0020  DNA repair protein RecO  39.43 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.144319  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0990  DNA replication and repair protein RecO  36.59 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000715553  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0047  DNA repair protein RecO  34.85 
 
 		 251 aa  175  7e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1117  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  34.41 
 
 		 250 aa  171  9e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  29.63 
 
 		 263 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  28.98 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  27.27 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  27.27 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  27.27 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  27.27 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  27.27 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  27.27 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  27.69 
 
 		 248 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  27.27 
 
 		 248 aa  125  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  26.86 
 
 		 248 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  27.69 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  26.03 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1658  DNA repair protein RecO  23.67 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1624  DNA repair protein RecO  23.67 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  24.57 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1133  RecO family DNA repair protein  20.73 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.519914  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  22.27 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  23.29 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  22.92 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  20.66 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  24.66 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  23.98 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  20 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  22.08 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  22.18 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  22.04 
 
 		 244 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  21.99 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  22.8 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  19.22 
 
 		 260 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1411  DNA repair protein RecO  23.39 
 
 		 244 aa  53.5  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000257171  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  21.83 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0790  DNA repair protein RecO  26.11 
 
 		 249 aa  52.8  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000558246  normal  0.055878 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  24.67 
 
 		 243 aa  52.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  22.58 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  22.31 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  22.58 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1986  DNA repair protein RecO  23.12 
 
 		 225 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2271  DNA repair protein RecO  23.12 
 
 		 225 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3559  DNA repair protein RecO  23.44 
 
 		 275 aa  49.3  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.030198  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  20.66 
 
 		 250 aa  48.9  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2883  DNA repair protein RecO  24.74 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.108982  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07620  DNA repair protein RecO  20.95 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.572835 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf127  recombinational DNA repair protein O  39.66 
 
 		 220 aa  44.7  0.002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2799  DNA repair protein RecO  22.67 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  23.33 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  22.41 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  22.54 
 
 		 253 aa  42  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>