More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0732 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  100 
 
 
461 aa  956    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  64.11 
 
 
460 aa  623  1e-177  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  64.32 
 
 
461 aa  622  1e-177  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  63.89 
 
 
462 aa  618  1e-176  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  63.6 
 
 
459 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  62.14 
 
 
459 aa  612  9.999999999999999e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  63.16 
 
 
481 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  62.31 
 
 
462 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  62.25 
 
 
462 aa  600  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  61.81 
 
 
462 aa  598  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  62.03 
 
 
462 aa  600  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  61.81 
 
 
462 aa  598  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  62.03 
 
 
462 aa  600  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  62.03 
 
 
462 aa  597  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  61.4 
 
 
463 aa  596  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  60.96 
 
 
463 aa  592  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  61.59 
 
 
462 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  61.37 
 
 
462 aa  594  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  56.48 
 
 
459 aa  539  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  56.48 
 
 
459 aa  539  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  53.85 
 
 
463 aa  516  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  53.39 
 
 
459 aa  510  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  53.64 
 
 
456 aa  510  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  53.19 
 
 
460 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  52.63 
 
 
464 aa  506  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  54.73 
 
 
461 aa  501  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2889  argininosuccinate lyase  52.83 
 
 
462 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438761 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3714  argininosuccinate lyase  52.39 
 
 
462 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.564837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3660  argininosuccinate lyase  52.39 
 
 
462 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  52.39 
 
 
459 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  51.98 
 
 
458 aa  490  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  51.85 
 
 
475 aa  491  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 
478 aa  487  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  51.1 
 
 
461 aa  486  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  52.9 
 
 
466 aa  487  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1807  argininosuccinate lyase  51.2 
 
 
461 aa  482  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  51.45 
 
 
467 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  51.3 
 
 
469 aa  482  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  52.19 
 
 
462 aa  483  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
464 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  51.43 
 
 
458 aa  481  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
468 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  50.88 
 
 
457 aa  478  1e-134  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  51.21 
 
 
461 aa  480  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
491 aa  479  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  50.77 
 
 
458 aa  480  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  51.32 
 
 
459 aa  481  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
464 aa  481  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
458 aa  480  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0740  argininosuccinate lyase  50.98 
 
 
463 aa  481  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121768  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  51.22 
 
 
466 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 
464 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  52.27 
 
 
469 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 
457 aa  475  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
499 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  51.32 
 
 
473 aa  475  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  51.12 
 
 
467 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 
466 aa  476  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  50.56 
 
 
467 aa  478  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  50.56 
 
 
467 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  51.43 
 
 
466 aa  474  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 
464 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  51.43 
 
 
493 aa  473  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26580  argininosuccinate lyase  50.77 
 
 
466 aa  472  1e-132  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000988334  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1047  argininosuccinate lyase  50.67 
 
 
460 aa  474  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00526091  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
468 aa  474  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  51.97 
 
 
459 aa  474  1e-132  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
462 aa  472  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  49.66 
 
 
465 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 
458 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 
464 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 
467 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  49.01 
 
 
464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 
458 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  48.79 
 
 
464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  50.89 
 
 
460 aa  470  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  50.34 
 
 
467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  49.46 
 
 
468 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 
466 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 
458 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  50 
 
 
459 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
462 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2475  argininosuccinate lyase  50.55 
 
 
474 aa  467  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  48.45 
 
 
464 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  47.94 
 
 
458 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2065  argininosuccinate lyase  50.98 
 
 
465 aa  467  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.247909 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 
463 aa  465  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2754  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
467 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  48.45 
 
 
464 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  51.63 
 
 
504 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
466 aa  461  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  49.66 
 
 
466 aa  462  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2445  argininosuccinate lyase  48.9 
 
 
471 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10802  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
469 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  51.36 
 
 
463 aa  465  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0730  argininosuccinate lyase  49 
 
 
461 aa  463  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.410396  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0937  argininosuccinate lyase  49.67 
 
 
470 aa  463  1e-129  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.941991  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  50 
 
 
476 aa  462  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1901  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 
460 aa  463  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>