77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0730 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0730  choloylglycine hydrolase  100 
 
 
325 aa  671    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000286672  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0959  penicillin V acylase related amidase  56.83 
 
 
325 aa  388  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555558  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0705  choloylglycine hydrolase  37.99 
 
 
329 aa  223  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.984776  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12270  penicillin V acylase-like amidase  36.08 
 
 
315 aa  200  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1046  choloylglycine hydrolase  36.28 
 
 
328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0054  conjugated bile salt hydrolase-like protein  35.71 
 
 
316 aa  196  3e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3807  choloylglycine hydrolase family protein  36.36 
 
 
328 aa  195  9e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3508  choloylglycine hydrolase  36.06 
 
 
328 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3779  choloylglycine hydrolase family protein  36.06 
 
 
328 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0181164 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3611  choloylglycine hydrolase family protein  35.76 
 
 
328 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3898  choloylglycine hydrolase family protein  35.76 
 
 
328 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4255  choloylglycine hydrolase  34.64 
 
 
328 aa  192  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585447 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3801  choloylglycine hydrolase family protein  36.06 
 
 
328 aa  192  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3538  choloylglycine hydrolase  36.06 
 
 
328 aa  192  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0536  conjugated bile acid hydrolase  34.78 
 
 
317 aa  189  5e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.969488  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1038  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  31.21 
 
 
333 aa  159  5e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0690  Choloylglycine hydrolase  31.34 
 
 
401 aa  154  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1422  choloylglycine hydrolase family protein  29.45 
 
 
394 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1468  choloylglycine hydrolase family protein  29.79 
 
 
333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3557  Penicillin amidase  28.61 
 
 
367 aa  139  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0227  penicillin V acylase, putative  29.91 
 
 
326 aa  136  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1703  penicillin amidase  28.35 
 
 
369 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00470395  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1447  choloylglycine hydrolase  30.88 
 
 
366 aa  132  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02193  hypothetical protein  29.5 
 
 
363 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0266  penicillin amidase  27.48 
 
 
330 aa  126  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0259  penicillin amidase  27.48 
 
 
330 aa  126  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2365  choloylglycine hydrolase  29.34 
 
 
362 aa  125  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0916  penicillin amidase  28.21 
 
 
336 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1155  choloylglycine hydrolase family protein  30.15 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1348  choloylglycine hydrolase family protein  29.85 
 
 
326 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00388269  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1576  choloylglycine hydrolase  28.92 
 
 
373 aa  108  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0992  choloylglycine hydrolase  27.93 
 
 
397 aa  102  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0580  penicillin V acylase or related amidase  27.61 
 
 
308 aa  90.1  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0575  choloylglycine hydrolase  23.82 
 
 
364 aa  86.7  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0643  choloylglycine hydrolase  26.75 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1796  choloylglycine hydrolase  24.32 
 
 
363 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1630  choloylglycine hydrolase  24.39 
 
 
362 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1644  choloylglycine hydrolase  24.39 
 
 
363 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1711  choloylglycine hydrolase  24.32 
 
 
363 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1652  choloylglycine hydrolase  24.32 
 
 
363 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.756503  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0747  Choloylglycine hydrolase  22.56 
 
 
347 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1745  Choloylglycine hydrolase  25 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3497  choloylglycine hydrolase  22.93 
 
 
355 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2364  choloylglycine hydrolase  23.87 
 
 
368 aa  67.4  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421243  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1956  twin-arginine translocation pathway signal  22.78 
 
 
355 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550247  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2085  Choloylglycine hydrolase  22.47 
 
 
355 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5516  choloylglycine hydrolase  23.89 
 
 
337 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6641  Choloylglycine hydrolase  22.76 
 
 
359 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3501  Choloylglycine hydrolase  23.29 
 
 
342 aa  63.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4062  Choloylglycine hydrolase  25.07 
 
 
350 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1920  choloylglycine hydrolase  21.61 
 
 
356 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0876  choloylglycine hydrolase  23.96 
 
 
354 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4334  choloylglycine hydrolase  21.34 
 
 
341 aa  60.1  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.684328  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2883  choloylglycine hydrolase, putative  21.75 
 
 
356 aa  59.3  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2503  Choloylglycine hydrolase  21.75 
 
 
356 aa  59.3  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0442  choloylglycine hydrolase  31.58 
 
 
359 aa  57.4  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.264988  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1884  Choloylglycine hydrolase  23.87 
 
 
335 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2282  Choloylglycine hydrolase  21.79 
 
 
355 aa  57.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0360  putative hydrolase  22.33 
 
 
358 aa  56.6  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05258  penicillin acylase  26.14 
 
 
371 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2150  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  22.44 
 
 
347 aa  55.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.17622 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1699  choloylglycine hydrolase  22.22 
 
 
355 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1302  choloylglycine hydrolase  23.27 
 
 
327 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0839  Choloylglycine hydrolase  23.83 
 
 
331 aa  53.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5004  Choloylglycine hydrolase  25 
 
 
311 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3064  choloylglycine hydrolase  33.73 
 
 
96 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.502301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5941  Penicillin V acylase and related amidase-like protein  34.86 
 
 
349 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  hitchhiker  0.00491026 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3412  choloylglycine hydrolase  20.89 
 
 
357 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.107785  normal  0.0295441 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2127  choloylglycine hydrolase  22.49 
 
 
427 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.677664  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3119  Choloylglycine hydrolase  22.36 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2225  Choloylglycine hydrolase  19.88 
 
 
358 aa  47  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2831  choloylglycine hydrolase  22.61 
 
 
350 aa  47  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0142441  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2387  choloylglycine hydrolase family protein  21.54 
 
 
352 aa  46.2  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389059  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3467  choloylglycine hydrolase  20.83 
 
 
376 aa  46.2  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0837  hypothetical protein  23.67 
 
 
332 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0866  hypothetical protein  23.67 
 
 
332 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2891  peptidase C45, acyl-coenzyme A:6-aminopenicillanic acid acyl-transferase  29.41 
 
 
431 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000570902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>