More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0726 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  100 
 
 		 247 aa  508  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  70.78 
 
 		 244 aa  372  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0629  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  68.72 
 
 		 244 aa  350  2e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.79 
 
 		 240 aa  319  3e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  61.57 
 
 		 241 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  63.79 
 
 		 240 aa  317  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1427  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  61.16 
 
 		 254 aa  314  9.999999999999999e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.798316  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  60.74 
 
 		 241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  60.74 
 
 		 241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.74 
 
 		 241 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  62.75 
 
 		 244 aa  311  5.999999999999999e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  60.33 
 
 		 241 aa  310  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  60.33 
 
 		 241 aa  310  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  60.74 
 
 		 241 aa  308  4e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  60.74 
 
 		 241 aa  308  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  60.74 
 
 		 241 aa  308  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  60.74 
 
 		 241 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  60.74 
 
 		 241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  61.98 
 
 		 241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  60.73 
 
 		 244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  60.58 
 
 		 242 aa  300  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  58.92 
 
 		 242 aa  300  1e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61 
 
 		 240 aa  300  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  61.32 
 
 		 240 aa  300  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  60.17 
 
 		 242 aa  299  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  58.85 
 
 		 246 aa  299  3e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  59.34 
 
 		 242 aa  299  3e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  60.17 
 
 		 242 aa  299  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.58 
 
 		 240 aa  298  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.58 
 
 		 240 aa  298  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.58 
 
 		 240 aa  298  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.58 
 
 		 240 aa  298  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.58 
 
 		 240 aa  298  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  60 
 
 		 244 aa  298  5e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  61 
 
 		 240 aa  298  5e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  60 
 
 		 244 aa  298  6e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  60.17 
 
 		 240 aa  298  7e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.58 
 
 		 240 aa  297  8e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.32 
 
 		 244 aa  297  8e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61 
 
 		 240 aa  297  9e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  57.61 
 
 		 247 aa  297  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.17 
 
 		 240 aa  297  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  58.85 
 
 		 240 aa  297  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  60.58 
 
 		 239 aa  297  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  59.5 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  60.41 
 
 		 257 aa  296  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  58.26 
 
 		 249 aa  295  3e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.58 
 
 		 258 aa  296  3e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  58.85 
 
 		 240 aa  295  5e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  59.75 
 
 		 240 aa  295  6e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  59.26 
 
 		 240 aa  295  6e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.09 
 
 		 240 aa  294  9e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  58.44 
 
 		 242 aa  293  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  58.33 
 
 		 247 aa  292  3e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  59.67 
 
 		 243 aa  291  5e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  58.92 
 
 		 240 aa  291  5e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.26 
 
 		 246 aa  291  5e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  58.44 
 
 		 240 aa  291  6e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  58.51 
 
 		 252 aa  291  8e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  58.3 
 
 		 244 aa  291  9e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  60.08 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  58.54 
 
 		 249 aa  289  4e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  59.26 
 
 		 243 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  57.79 
 
 		 246 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  57.61 
 
 		 240 aa  288  6e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  58.85 
 
 		 243 aa  288  6e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  58.51 
 
 		 246 aa  288  7e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  58.78 
 
 		 257 aa  288  8e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  54.32 
 
 		 254 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  58.85 
 
 		 242 aa  286  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  58.33 
 
 		 246 aa  287  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  58.09 
 
 		 253 aa  286  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  57.02 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  57.2 
 
 		 273 aa  286  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  55.19 
 
 		 242 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 270 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7665  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.37 
 
 		 255 aa  286  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1445  ABC transporter related  55.14 
 
 		 249 aa  285  4e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.124868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 		 240 aa  285  4e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  56.38 
 
 		 242 aa  285  5e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  57.44 
 
 		 246 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  56.79 
 
 		 240 aa  285  5e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  59.75 
 
 		 242 aa  285  5e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  58.26 
 
 		 246 aa  284  7e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  58.68 
 
 		 242 aa  284  8e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  56.38 
 
 		 244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  56.02 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  56.38 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  57.61 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  57.61 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  58.26 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  58.02 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  56.73 
 
 		 247 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  57.79 
 
 		 243 aa  282  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  56.97 
 
 		 243 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  59.43 
 
 		 243 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  57.61 
 
 		 247 aa  281  8.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  57.92 
 
 		 244 aa  281  9e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  56.15 
 
 		 247 aa  281  9e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  53.31 
 
 		 254 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>