More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0705 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  100 
 
 		 190 aa  378  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  59.2 
 
 		 192 aa  199  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  47.67 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1026  heat shock protein GrpE  50 
 
 		 190 aa  141  7e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000103235  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  38.95 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0162  heat shock protein GrpE  50.75 
 
 		 204 aa  138  3.9999999999999997e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  48.3 
 
 		 189 aa  137  7.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  45.22 
 
 		 213 aa  135  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  41.54 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0096  heat shock protein GrpE  48.51 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  39.51 
 
 		 208 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  47.26 
 
 		 208 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  47.26 
 
 		 208 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  38.5 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  40.4 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  40.4 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  40.4 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  40.4 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  40.4 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  37.91 
 
 		 180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  37.87 
 
 		 188 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 		 188 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 		 188 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  38.86 
 
 		 178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  40.4 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  42.48 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  39.55 
 
 		 178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  39.07 
 
 		 192 aa  111  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  37.7 
 
 		 175 aa  110  8.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  39.07 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  38.38 
 
 		 180 aa  108  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2497  putative heat shock protein  39.89 
 
 		 182 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.437332 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  41.33 
 
 		 184 aa  107  8.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  36.71 
 
 		 206 aa  107  9.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  36.46 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  41.22 
 
 		 179 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  37.42 
 
 		 195 aa  105  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  39.32 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.48 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  41.67 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  39.86 
 
 		 179 aa  105  5e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  37.08 
 
 		 181 aa  104  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  42.22 
 
 		 210 aa  104  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1259  heat shock protein GrpE  41.67 
 
 		 176 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.481119  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  38.86 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  41.48 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  37.42 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1643  GrpE protein  34.69 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120336  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  33.33 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2639  heat shock protein GrpE  37.14 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  39.86 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  41.56 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  39.16 
 
 		 178 aa  101  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 188 aa  101  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  39.86 
 
 		 181 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  39.86 
 
 		 181 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  39.16 
 
 		 185 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  39.16 
 
 		 185 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  39.16 
 
 		 185 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  39.16 
 
 		 185 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  39.16 
 
 		 185 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  39.16 
 
 		 185 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  39.16 
 
 		 185 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  39.26 
 
 		 192 aa  100  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  35.98 
 
 		 212 aa  100  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  38.06 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14947  mitochondrial GrpE-like protein  34.21 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0088904  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  36.31 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  39.86 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  32.77 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  39.86 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  39.86 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  39.86 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  38.52 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  39.86 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  36.99 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  37.59 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  38.12 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  38.85 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  38.06 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  32.61 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  38.67 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  40.12 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  37.09 
 
 		 189 aa  99  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  39.35 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  34.97 
 
 		 200 aa  98.6  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 		 201 aa  98.6  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  38.15 
 
 		 226 aa  98.2  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 199 aa  98.2  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  34.86 
 
 		 213 aa  97.8  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  39.72 
 
 		 230 aa  97.4  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  38.26 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  39.72 
 
 		 230 aa  97.4  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 		 201 aa  97.1  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  35.48 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2468  heat shock protein GrpE  38.82 
 
 		 215 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.338096  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  36.81 
 
 		 185 aa  96.3  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  37.14 
 
 		 194 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  34.44 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>