298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0700 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0700  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 119 aa  239  7.999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00262073  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1354  ribosome-binding factor A  66.97 
 
 		 117 aa  155  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0818  ribosome-binding factor A  57.02 
 
 		 119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0384  ribosome-binding factor A  53.1 
 
 		 117 aa  134  5e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0382  ribosome-binding factor A  51.75 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0434  ribosome-binding factor A  46.28 
 
 		 121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0815  ribosome-binding factor A  46.09 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0116201  normal  0.0354189 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  44.35 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  44.35 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  44.35 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  43.48 
 
 		 118 aa  103  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  44.64 
 
 		 118 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  44.64 
 
 		 118 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  43.48 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  43.48 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 118 aa  101  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 118 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 118 aa  101  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  45.37 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  46.3 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  40.35 
 
 		 117 aa  98.6  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  38.05 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  44.14 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  38.05 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  44.25 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  41.67 
 
 		 118 aa  92.8  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  38.05 
 
 		 116 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  41.67 
 
 		 121 aa  90.5  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  40.71 
 
 		 119 aa  88.6  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 131 aa  88.6  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  38.26 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 		 122 aa  88.6  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  38.89 
 
 		 119 aa  88.2  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  39.82 
 
 		 118 aa  87.8  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  36.7 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  37.96 
 
 		 119 aa  87  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  40.71 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  41.44 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  39.29 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  41.03 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  39.09 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1427  ribosome-binding factor A  38.39 
 
 		 175 aa  84  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000533542 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  33.91 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  39.64 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1124  ribosome-binding factor A  40.35 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.559774  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  36.13 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  37.93 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  36.52 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1417  ribosome-binding factor A  38.39 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0421454  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  34.51 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  37.72 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1466  ribosome-binding factor A  34.75 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  41.28 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  36.44 
 
 		 133 aa  80.1  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2488  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  38.39 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  38.89 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  45.05 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2451  ribosome-binding factor A  33.02 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0315755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  36.61 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  38.18 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2204  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  38.18 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  38.18 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2118  Ribosome-binding factor A-like protein  37.38 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.376562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4038  ribosome-binding factor A  39.47 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173989  normal  0.432163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2315  ribosome-binding factor A  39.81 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0767134 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  36.28 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  35.65 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  34.78 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1511  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.898255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  38.32 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  35.96 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3464  ribosome-binding factor A  34.71 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3189  ribosome-binding factor A  38.68 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0454193  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2135  ribosome-binding factor A  34.55 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0168697  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  36.45 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23440  ribosome-binding factor A  43.88 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.487539  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1212  ribosome-binding factor A  44.33 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.316878  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0490  ribosome-binding factor A  34.15 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1020  ribosome-binding factor A  39.25 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03034  ribosome-binding factor A  36.52 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0538  ribosome-binding factor A  36.52 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3463  ribosome-binding factor A  36.52 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.287723 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  36.21 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4488  ribosome-binding factor A  36.52 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2748  ribosome-binding factor A  35.85 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131099  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3651  ribosome-binding factor A  36.52 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02985  hypothetical protein  36.52 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  32.46 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  32.46 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3359  ribosome-binding factor A  36.52 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0531  ribosome-binding factor A  36.52 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>