More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0684 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  100 
 
 
262 aa  541  1e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  73.86 
 
 
271 aa  402  1e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  71.81 
 
 
255 aa  388  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  72.2 
 
 
256 aa  385  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000152831  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  74.57 
 
 
255 aa  380  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  67.43 
 
 
258 aa  376  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  71.3 
 
 
233 aa  363  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  71.18 
 
 
235 aa  363  1e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  70.21 
 
 
238 aa  363  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  70.13 
 
 
235 aa  362  4e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  72.49 
 
 
233 aa  361  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  72.93 
 
 
233 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  72.49 
 
 
233 aa  361  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  72.05 
 
 
233 aa  360  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  72.05 
 
 
233 aa  360  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  72.05 
 
 
233 aa  360  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  72.05 
 
 
233 aa  360  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  72.05 
 
 
233 aa  360  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  72.05 
 
 
233 aa  360  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  72.05 
 
 
233 aa  360  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  72.05 
 
 
233 aa  360  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  67.33 
 
 
252 aa  358  6e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  70.94 
 
 
235 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  70.18 
 
 
257 aa  352  4e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  68.12 
 
 
244 aa  352  4e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  65.49 
 
 
260 aa  348  5e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  67.23 
 
 
262 aa  347  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  67.67 
 
 
232 aa  345  6e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  67.84 
 
 
255 aa  343  1e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  67.84 
 
 
255 aa  343  1e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  67.84 
 
 
262 aa  342  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  68.75 
 
 
248 aa  341  8e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  68.42 
 
 
236 aa  339  2e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  65.69 
 
 
252 aa  335  3.9999999999999995e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  66.23 
 
 
244 aa  335  5.999999999999999e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  66.96 
 
 
246 aa  332  3e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  66.52 
 
 
232 aa  330  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  60.56 
 
 
281 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  64.83 
 
 
259 aa  322  5e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  59.92 
 
 
257 aa  320  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  57.6 
 
 
301 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  59.52 
 
 
257 aa  318  5e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  64.26 
 
 
280 aa  318  5e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  64.81 
 
 
233 aa  318  6e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  64.81 
 
 
233 aa  318  6e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  64.76 
 
 
257 aa  314  7e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  62.71 
 
 
255 aa  314  7e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  58.57 
 
 
314 aa  314  9e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  58.57 
 
 
343 aa  314  9e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  62.71 
 
 
255 aa  314  9e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  63.39 
 
 
315 aa  313  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  60.34 
 
 
267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  62.55 
 
 
251 aa  311  4.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  59.51 
 
 
301 aa  311  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  62.23 
 
 
251 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  62.45 
 
 
256 aa  311  9e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  64.32 
 
 
243 aa  310  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  62.95 
 
 
289 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  60.76 
 
 
274 aa  309  2.9999999999999997e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  63.16 
 
 
288 aa  308  8e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  62.56 
 
 
260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  62.56 
 
 
262 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  55.2 
 
 
279 aa  299  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  56.22 
 
 
264 aa  299  4e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  55.65 
 
 
316 aa  295  5e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  55.24 
 
 
282 aa  295  6e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1161  30S ribosomal protein S2  56.71 
 
 
272 aa  295  6e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000246943 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  56.97 
 
 
304 aa  295  6e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  56 
 
 
289 aa  295  7e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  57.89 
 
 
287 aa  294  8e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  54.2 
 
 
314 aa  293  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  60.71 
 
 
300 aa  294  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  58.33 
 
 
284 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  58.33 
 
 
284 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  58.33 
 
 
284 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4883  30S ribosomal protein S2  53.63 
 
 
264 aa  293  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  58.85 
 
 
273 aa  293  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2061  30S ribosomal protein S2  53.52 
 
 
265 aa  292  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.4963 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  56.43 
 
 
272 aa  292  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  52.29 
 
 
262 aa  291  6e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1840  SSU ribosomal protein S2P  57.96 
 
 
262 aa  291  9e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4236  30S ribosomal protein S2  53.11 
 
 
260 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000647656 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1180  ribosomal protein S2  59.11 
 
 
317 aa  290  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.920095  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0577  30S ribosomal protein S2  55.06 
 
 
294 aa  289  3e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000845501  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  58.55 
 
 
261 aa  289  4e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  60.54 
 
 
303 aa  289  4e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1529  ribosomal protein S2  54.98 
 
 
344 aa  289  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2530  30S ribosomal protein S2  55.13 
 
 
251 aa  288  5.0000000000000004e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.963698  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  57.14 
 
 
296 aa  287  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09890  SSU ribosomal protein S2P  61.21 
 
 
278 aa  287  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  60.27 
 
 
292 aa  287  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  58.23 
 
 
246 aa  287  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2924  30S ribosomal protein S2  59.82 
 
 
271 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.240537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  57.02 
 
 
254 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  56.3 
 
 
283 aa  286  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1133  30S ribosomal protein S2  57.69 
 
 
260 aa  286  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23610  SSU ribosomal protein S2P  59.11 
 
 
317 aa  286  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.699441  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5911  ribosomal protein S2  58.04 
 
 
304 aa  286  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  54.8 
 
 
269 aa  285  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0080  ribosomal protein S2  56.77 
 
 
263 aa  285  5e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000155744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>