More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0637 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  53.43 
 
 		 607 aa  668    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  53.43 
 
 		 607 aa  668    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  51.58 
 
 		 603 aa  651    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  54.26 
 
 		 598 aa  665    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5044  GTP-binding protein TypA  51.74 
 
 		 606 aa  662    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  52.01 
 
 		 606 aa  648    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  67.72 
 
 		 615 aa  861    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  53.16 
 
 		 606 aa  665    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  57.41 
 
 		 600 aa  702    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  52.31 
 
 		 606 aa  647    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  66.45 
 
 		 614 aa  874    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0606  GTP-binding protein TypA  51.83 
 
 		 605 aa  649    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  52.15 
 
 		 602 aa  653    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  71.88 
 
 		 613 aa  900    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  52.32 
 
 		 604 aa  658    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  52.66 
 
 		 603 aa  668    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0361  GTP-binding protein TypA  52.74 
 
 		 606 aa  662    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  66.45 
 
 		 614 aa  874    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  66.45 
 
 		 614 aa  874    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  66.45 
 
 		 614 aa  874    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  52.64 
 
 		 608 aa  660    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  51.5 
 
 		 608 aa  653    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  51.5 
 
 		 608 aa  654    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4815  GTP-binding protein TypA  52.4 
 
 		 606 aa  656    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0339  putative regulatory protein TypA or elongation factor Tu  51.15 
 
 		 615 aa  647    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.597633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  50.82 
 
 		 613 aa  638    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  52.64 
 
 		 608 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  56.66 
 
 		 598 aa  688    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  51.16 
 
 		 606 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  52.48 
 
 		 608 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  52.98 
 
 		 610 aa  681    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  68.71 
 
 		 615 aa  867    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  55.69 
 
 		 596 aa  667    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  52.64 
 
 		 608 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  53.54 
 
 		 609 aa  674    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  52.48 
 
 		 606 aa  674    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3483  GTP-binding virulence regulator protein BipA  51.67 
 
 		 607 aa  655    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  54.38 
 
 		 602 aa  681    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  51.98 
 
 		 608 aa  653    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  52.12 
 
 		 610 aa  649    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  56.56 
 
 		 600 aa  696    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  53.11 
 
 		 608 aa  648    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  57.12 
 
 		 602 aa  702    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  52.92 
 
 		 598 aa  653    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0169  GTP-binding protein TypA  50.74 
 
 		 607 aa  645    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  66.45 
 
 		 614 aa  874    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0006  GTP-binding protein TypA  51.58 
 
 		 600 aa  637    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  54.76 
 
 		 598 aa  670    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  55.88 
 
 		 597 aa  671    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  53 
 
 		 603 aa  677    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  54.59 
 
 		 598 aa  668    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  54.41 
 
 		 592 aa  643    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  52.48 
 
 		 608 aa  655    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  55.71 
 
 		 596 aa  669    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  52.64 
 
 		 608 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  57.76 
 
 		 614 aa  720    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  52.32 
 
 		 602 aa  654    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  54.59 
 
 		 598 aa  668    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  51.41 
 
 		 609 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  53.07 
 
 		 599 aa  649    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0153  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 605 aa  635    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.143377  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  53 
 
 		 602 aa  653    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1224  GTP-binding protein TypA  51.4 
 
 		 605 aa  644    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  51.89 
 
 		 608 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  51.99 
 
 		 603 aa  655    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0239  GTP-binding protein TypA  50.82 
 
 		 608 aa  652    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  54.68 
 
 		 600 aa  668    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0373  GTP-binding protein TypA  50.82 
 
 		 615 aa  644    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554499  normal  0.0314222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2024  GTP-binding protein TypA  51.82 
 
 		 607 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  52.5 
 
 		 605 aa  649    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  55.29 
 
 		 593 aa  656    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  52.47 
 
 		 607 aa  669    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  56.9 
 
 		 598 aa  686    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  51.98 
 
 		 608 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  54.21 
 
 		 623 aa  681    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  52.48 
 
 		 608 aa  659    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  53.66 
 
 		 610 aa  666    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  53.82 
 
 		 610 aa  667    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4918  GTP-binding protein TypA  51.9 
 
 		 606 aa  662    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  54.5 
 
 		 596 aa  666    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  52.16 
 
 		 603 aa  660    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  52.16 
 
 		 603 aa  660    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  55.04 
 
 		 602 aa  685    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  51.92 
 
 		 603 aa  659    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0339  GTP-binding protein TypA  53.65 
 
 		 608 aa  666    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0649933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  52.15 
 
 		 608 aa  656    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  53.42 
 
 		 605 aa  669    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2298  membrane GTPase for stress response  69.24 
 
 		 613 aa  880    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0807  stress response membrane GTPase  77.27 
 
 		 611 aa  986    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0319085  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1181  stress response membrane GTPase  73.85 
 
 		 618 aa  952    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0076831  hitchhiker  0.00656826 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1342  stress response membrane GTPase  74.02 
 
 		 613 aa  950    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0910775  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  70.54 
 
 		 615 aa  899    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  52.92 
 
 		 603 aa  665    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  51.98 
 
 		 608 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  52.64 
 
 		 608 aa  660    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1545  GTP-binding protein TypA  52.73 
 
 		 611 aa  655    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  52.9 
 
 		 603 aa  667    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  53.82 
 
 		 602 aa  669    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  53.08 
 
 		 601 aa  650    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2316  GTP-binding protein TypA  52.67 
 
 		 609 aa  656    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>