More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0611 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0611  aspartate kinase  100 
 
 		 452 aa  926    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0132396  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1078  aspartate kinase  61.56 
 
 		 451 aa  592  1e-168  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0935045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0784  aspartate kinase  57.11 
 
 		 451 aa  527  1e-148  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1544  aspartate kinase  51.55 
 
 		 479 aa  503  1e-141  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3141  aspartate kinase  47.01 
 
 		 458 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000375152  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3293  aspartate kinase  46.78 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0339  aspartate kinase  43.33 
 
 		 450 aa  382  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.893202  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0425  aspartate kinase  43.46 
 
 		 452 aa  384  1e-105  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1388  aspartate kinase  43.05 
 
 		 460 aa  382  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0011812  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1415  aspartate kinase  43.05 
 
 		 460 aa  382  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000337158  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0528  aspartate kinase  42.45 
 
 		 454 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000180899  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0896  aspartate kinase  42.95 
 
 		 458 aa  378  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0170184  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1375  aspartate kinase  40.58 
 
 		 449 aa  378  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000974637  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1540  aspartate kinase  42.05 
 
 		 452 aa  372  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0783  aspartate kinase  39.6 
 
 		 450 aa  347  4e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.016394  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2352  aspartate kinase  38.89 
 
 		 444 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000453597  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0541  aspartate kinase  34.59 
 
 		 442 aa  264  2e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116539  hitchhiker  0.00000501097 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16060  aspartate kinase  33.63 
 
 		 458 aa  236  6e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  hitchhiker  0.000000275523 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004457  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  26.72 
 
 		 819 aa  159  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3054  aspartate kinase  26.54 
 
 		 465 aa  156  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0808  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.63 
 
 		 819 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.693104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.22 
 
 		 820 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0437927  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3476  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.63 
 
 		 819 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1943  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.87 
 
 		 819 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0938577  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.22 
 
 		 820 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  28.39 
 
 		 823 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.22 
 
 		 820 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3604  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.63 
 
 		 819 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.331342  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.22 
 
 		 820 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1209  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.43 
 
 		 822 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1175  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.15 
 
 		 821 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.22 
 
 		 820 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2556  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.76 
 
 		 819 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1138  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.22 
 
 		 822 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.592327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.75 
 
 		 815 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3653  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.53 
 
 		 820 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.53 
 
 		 820 aa  152  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.761608  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00002  bifunctional aspartokinase I/homoserine dehydrogenase I  25.53 
 
 		 820 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.843244  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3594  aspartate kinase  25.53 
 
 		 820 aa  152  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1304  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.85 
 
 		 822 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3086  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.85 
 
 		 822 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361224 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.53 
 
 		 820 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2735  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.85 
 
 		 822 aa  152  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331448  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0533  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.33 
 
 		 818 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00002  hypothetical protein  25.53 
 
 		 820 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.964701  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.53 
 
 		 820 aa  152  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.880494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1227  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.85 
 
 		 822 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248469  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.53 
 
 		 820 aa  152  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1271  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.82 
 
 		 822 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.279623  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1139  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.58 
 
 		 822 aa  151  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0421485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3863  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.74 
 
 		 819 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129466  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00939  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.92 
 
 		 819 aa  150  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0683  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.58 
 
 		 819 aa  150  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000368651  normal  0.0727527 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0572  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.48 
 
 		 818 aa  150  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  28.78 
 
 		 814 aa  149  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3668  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.32 
 
 		 819 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  25.21 
 
 		 471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3415  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.22 
 
 		 822 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3580  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.79 
 
 		 820 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1275  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.42 
 
 		 820 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0564  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.64 
 
 		 820 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.21 
 
 		 818 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0861  aspartate kinase  28.42 
 
 		 472 aa  147  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  26.46 
 
 		 468 aa  146  6e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1079  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.05 
 
 		 822 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.555098 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0401  aspartate kinase  25.85 
 
 		 462 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.271601 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1066  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.36 
 
 		 821 aa  144  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0142  aspartate kinase  25.42 
 
 		 463 aa  143  7e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  25.73 
 
 		 471 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.43 
 
 		 819 aa  142  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1983  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.91 
 
 		 819 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0259928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2740  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.11 
 
 		 825 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363981  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0259  aspartate kinase  26.38 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.889739  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  27.58 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.3 
 
 		 817 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44504  predicted protein  24.26 
 
 		 463 aa  138  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0577  aspartate kinase  26.38 
 
 		 468 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.798745  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6475  aspartate kinase  25.75 
 
 		 446 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1253  aspartate kinase  25.91 
 
 		 465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.312523  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.68 
 
 		 815 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  24.53 
 
 		 471 aa  136  6.0000000000000005e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4508  aspartate kinase  28.18 
 
 		 478 aa  136  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.995886  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03328  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.49 
 
 		 804 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1754  aspartate kinase  24.31 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  24 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  24.64 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1270  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.84 
 
 		 821 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.739227  hitchhiker  0.00698149 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1642  aspartate kinase  25.96 
 
 		 468 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13741  aspartate kinase  27.83 
 
 		 421 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.500059  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1304  aspartate kinase  28.08 
 
 		 440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.928497 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  27.07 
 
 		 469 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2906  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  24.26 
 
 		 821 aa  134  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  25 
 
 		 471 aa  133  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  25.32 
 
 		 451 aa  133  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0905  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.05 
 
 		 821 aa  133  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1214  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.06 
 
 		 816 aa  133  7.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3187  aspartate kinase  27.66 
 
 		 467 aa  133  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4889  aspartate kinase  28.08 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.213019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4978  aspartate kinase  28.08 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.922524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5257  aspartate kinase  28.08 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>