More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0572 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  100 
 
 		 217 aa  448  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  66.83 
 
 		 208 aa  300  1e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  68.42 
 
 		 212 aa  299  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  66.03 
 
 		 210 aa  294  9e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  62.27 
 
 		 223 aa  291  6e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  66.67 
 
 		 212 aa  290  9e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  67.15 
 
 		 212 aa  290  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  66.67 
 
 		 212 aa  288  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  66.67 
 
 		 212 aa  288  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  66.67 
 
 		 212 aa  288  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  66.67 
 
 		 215 aa  288  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  66.67 
 
 		 212 aa  288  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  66.67 
 
 		 212 aa  288  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  66.67 
 
 		 212 aa  288  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  66.67 
 
 		 212 aa  288  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  66.18 
 
 		 212 aa  286  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  66.67 
 
 		 224 aa  281  7.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  62.5 
 
 		 211 aa  281  8.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  62.5 
 
 		 211 aa  281  8.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  61.5 
 
 		 263 aa  274  6e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  61.5 
 
 		 263 aa  274  6e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  65.96 
 
 		 191 aa  268  5.9999999999999995e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  60.1 
 
 		 211 aa  261  4e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  58.59 
 
 		 226 aa  241  5e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  52.22 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  43.65 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  43.65 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  43.65 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  43.65 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  43.65 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  43.65 
 
 		 216 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  43.65 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  43.65 
 
 		 216 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  43.15 
 
 		 216 aa  175  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  43.15 
 
 		 216 aa  174  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  42.5 
 
 		 216 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  41.21 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  40.82 
 
 		 313 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  41.36 
 
 		 239 aa  161  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  39.18 
 
 		 250 aa  161  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  39.59 
 
 		 271 aa  158  6e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  37.69 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  38.71 
 
 		 274 aa  150  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  37.89 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  41.53 
 
 		 249 aa  149  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  37.57 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00002331  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  35.78 
 
 		 277 aa  147  9e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  37.24 
 
 		 290 aa  146  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  38.02 
 
 		 204 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  35.9 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  36.7 
 
 		 223 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  34.83 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  35.26 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  36.77 
 
 		 247 aa  122  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  37.43 
 
 		 208 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  34.38 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  34.05 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  33.69 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  33.16 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  33.16 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  31.61 
 
 		 221 aa  95.9  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  29.94 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  28.92 
 
 		 388 aa  62.4  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5146  RelA/SpoT domain-containing protein  30.9 
 
 		 574 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1638  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  31.62 
 
 		 750 aa  59.3  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34257  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  28.57 
 
 		 362 aa  58.9  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  32.12 
 
 		 1046 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1212  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  29.7 
 
 		 716 aa  57.8  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0095  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  30.07 
 
 		 745 aa  57.8  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000291848  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1612  RelA/SpoT domain-containing protein  31.14 
 
 		 577 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2286  RelA/SpoT domain-containing protein  25.82 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0070  RelA/SpoT domain protein  29.11 
 
 		 570 aa  57.4  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1831  RelA/SpoT domain protein  32.03 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3432  hypothetical protein  33.9 
 
 		 341 aa  55.5  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000798174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0998  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.33 
 
 		 736 aa  55.5  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223153 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1455  RelA/SpoT domain-containing protein  28.4 
 
 		 359 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000111353  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1670  RelA/SpoT family protein  30.58 
 
 		 705 aa  55.5  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443961  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0303  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.58 
 
 		 705 aa  55.5  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0214  RelA/SpoT domain-containing protein  28.39 
 
 		 353 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000343543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2576  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  29.75 
 
 		 705 aa  54.7  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0223055 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3276  GDP/GTP pyrophosphokinase  32.23 
 
 		 744 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00140611  normal  0.0304818 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3162  GDP/GTP pyrophosphokinase  32.23 
 
 		 744 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00447218  normal  0.0412564 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1413  GTP pyrophosphokinase  31.4 
 
 		 734 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1571  GTP pyrophosphokinase  31.4 
 
 		 734 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3178  GDP/GTP pyrophosphokinase  32.23 
 
 		 744 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00141228  normal  0.185279 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1858  GTP pyrophosphokinase-like protein  26.58 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000143095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1575  GTP pyrophosphokinase-like protein  26.58 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000121431  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3115  GDP/GTP pyrophosphokinase  32.23 
 
 		 744 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0106723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3097  GDP/GTP pyrophosphokinase  32.23 
 
 		 744 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000040075  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0352  RelA/SpoT domain-containing protein  28.9 
 
 		 369 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3236  GDP/GTP pyrophosphokinase  32.23 
 
 		 743 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000465507  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2868  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  35.51 
 
 		 719 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.706713  normal  0.0333863 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1920  GTP pyrophosphokinase  29.3 
 
 		 718 aa  53.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.682982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4217  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  27.94 
 
 		 747 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.630753  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1033  GTP diphosphokinase  27.88 
 
 		 734 aa  53.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0165822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1399  RelA/SpoT domain protein  30.59 
 
 		 365 aa  53.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000071471  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1682  hypothetical protein  26.09 
 
 		 495 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.918456  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1856  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  27.82 
 
 		 715 aa  52.8  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.709628  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0377  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  34.71 
 
 		 846 aa  52  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000730209  normal  0.0150948 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1735  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  29.51 
 
 		 747 aa  52  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>