105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0543 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  100 
 
 		 172 aa  360  5.0000000000000005e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  40.65 
 
 		 167 aa  120  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.43 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  42.76 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  42.76 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  42.76 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  42.76 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  42.07 
 
 		 167 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  42.07 
 
 		 167 aa  117  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  40 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.76 
 
 		 163 aa  117  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0611  phosphoesterase  36.52 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  36.14 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  39.77 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  41.38 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  39.35 
 
 		 167 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  35.67 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  35.76 
 
 		 167 aa  107  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  34.46 
 
 		 177 aa  101  6e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  36.97 
 
 		 167 aa  97.1  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  36.97 
 
 		 167 aa  97.1  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  30.68 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.82 
 
 		 158 aa  84.7  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  38.52 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.04 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.85 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.05 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  34.87 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  33.13 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.3 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.05 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  34.21 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.81 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  33.83 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  32.61 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  31.08 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.07 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  33.57 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  28.41 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.51 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.61 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  31.21 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  31.21 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  29.11 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.43 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  30.28 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.34 
 
 		 227 aa  53.9  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  27.01 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.99 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.43 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.05 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.61 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  24.32 
 
 		 219 aa  51.2  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  30.91 
 
 		 183 aa  51.6  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  30.91 
 
 		 183 aa  51.6  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  30.91 
 
 		 183 aa  51.6  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  30.13 
 
 		 158 aa  51.2  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  30.5 
 
 		 163 aa  50.8  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  30.83 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  27.27 
 
 		 153 aa  48.9  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.28 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  33.57 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.05 
 
 		 170 aa  48.5  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  27.89 
 
 		 161 aa  47.8  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  29.66 
 
 		 164 aa  47.8  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  29.81 
 
 		 183 aa  47.4  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  26.44 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  35.29 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  27.01 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  35.85 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  27.01 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  27.54 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  27.33 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  27.33 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  27.33 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  27.33 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  27.33 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  35.16 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  25.44 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  29.45 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  26.71 
 
 		 183 aa  45.4  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.56 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.92 
 
 		 167 aa  44.7  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  30.77 
 
 		 185 aa  44.3  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  27.52 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  26.28 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  25 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  30.12 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  26.54 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  23.87 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  23.76 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  28.05 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  27.33 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.71 
 
 		 182 aa  42.4  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  24.84 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  23.81 
 
 		 190 aa  42  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  33.75 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  26.22 
 
 		 181 aa  41.6  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  26.72 
 
 		 160 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  31.37 
 
 		 181 aa  41.6  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>