260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0463 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
172 aa  342  2e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  48.08 
 
 
167 aa  150  8.999999999999999e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  47.74 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  43.42 
 
 
176 aa  131  5e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  43.23 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  39.38 
 
 
178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  40.13 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  37.58 
 
 
165 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  35.29 
 
 
168 aa  112  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  35.95 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  35.95 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  35.95 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  35.29 
 
 
168 aa  108  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  35.29 
 
 
168 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  35.29 
 
 
168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  35.29 
 
 
168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  35.29 
 
 
168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  35.29 
 
 
168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  35.29 
 
 
168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  35.33 
 
 
166 aa  107  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  39.24 
 
 
179 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  34.21 
 
 
164 aa  99  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  32.7 
 
 
173 aa  98.2  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  32.7 
 
 
173 aa  98.2  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  36.49 
 
 
203 aa  98.2  5e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  32.95 
 
 
175 aa  95.9  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  32.89 
 
 
171 aa  94  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  31.9 
 
 
203 aa  92  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  32.35 
 
 
175 aa  90.9  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  30.64 
 
 
175 aa  90.5  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  31.18 
 
 
175 aa  89.4  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  30.14 
 
 
167 aa  89.4  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  29.68 
 
 
165 aa  86.3  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  32.14 
 
 
175 aa  84.7  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  29.41 
 
 
175 aa  84.7  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  28 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  33.77 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  31.54 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  29.37 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  31.69 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  26.97 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1799  ATP synthase F0, B subunit  31.54 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.402009  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  24.52 
 
 
181 aa  77.4  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.92 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  26.53 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  33.58 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  23.49 
 
 
166 aa  73.9  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  31.54 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  28.95 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  28.19 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  30.2 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  30 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  28.17 
 
 
173 aa  72  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  28.29 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  30.07 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  32.03 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  28.29 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  32.03 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl111  ATP synthase subunit B  25.95 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  30.41 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  33.11 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  29.81 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  27.81 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  30.07 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0079  ATP synthase F0, B subunit  33.56 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1269  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  27.78 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  32.24 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  26.67 
 
 
193 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  24.85 
 
 
181 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  31.03 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0063  ATP synthase F0 subunit B  25.16 
 
 
164 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  33.77 
 
 
156 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2586  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.21 
 
 
203 aa  63.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60621  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  25.35 
 
 
156 aa  62.4  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.56 
 
 
189 aa  62.4  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  31.58 
 
 
156 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  28.3 
 
 
189 aa  61.6  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  32.19 
 
 
156 aa  61.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0080  ATP synthase F0, B subunit  24.05 
 
 
181 aa  60.8  0.000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  33.11 
 
 
156 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  26.71 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  26.92 
 
 
188 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf043  ATP synthase B chain  25.5 
 
 
176 aa  60.5  0.00000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  30.56 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  24.32 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  31.69 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3879  ATP synthase F0, B subunit  29.05 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000993244  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  29.33 
 
 
163 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  31.69 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  29.66 
 
 
156 aa  58.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  30.92 
 
 
156 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  30.92 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  30.92 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  28.1 
 
 
159 aa  56.6  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3078  F0F1 ATP synthase subunit B  30.2 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0404416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>