42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0458 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0458  YibE/F family protein  100 
 
 		 371 aa  744    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650445  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0110  multitransmembrane protein  40.61 
 
 		 360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000156468 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0364  multitransmembrane protein  36.41 
 
 		 365 aa  241  2e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0504  hypothetical protein  35.75 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.36708  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0491  hypothetical protein  35.75 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696499  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0532  multitransmembrane protein  38.38 
 
 		 361 aa  229  7e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0106  hypothetical protein  32.49 
 
 		 370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0866  hypothetical protein  35.56 
 
 		 372 aa  207  3e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2717  YibE/F family protein  29.28 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980244  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18650  predicted multitransmembrane protein  27 
 
 		 404 aa  106  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221349  normal  0.497385 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1552  YibE/F family protein  25.29 
 
 		 392 aa  103  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000166872  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01199  hypothetical protein  25.13 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2256  hypothetical protein  24.21 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000922663  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0869  hypothetical protein  26.57 
 
 		 370 aa  90.1  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1156  YibE/F family protein  27.64 
 
 		 385 aa  89.7  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2695  hypothetical protein  24.86 
 
 		 434 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2866  YibE/F family protein  24.86 
 
 		 451 aa  87  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.405695  hitchhiker  0.000000000000397965 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1617  YbiE/YbiF family membrane protein  25.42 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0997624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1717  YibE/F family protein  26.87 
 
 		 373 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000872311  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1217  multitransmembrane protein-like  26.16 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0513  YibE/F family protein  24.12 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0923  YibE/F family protein  24.29 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0732684  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4236  YibE/F family protein  26.51 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2291  YibE/F family protein  23.91 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2203  YibE/F family protein  23 
 
 		 599 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0625  YibE/F family protein  24.38 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0617008  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15190  predicted multitransmembrane protein  22.32 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0772315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1706  YibE/F family protein  23.73 
 
 		 513 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0105  hypothetical protein  25.48 
 
 		 261 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0503  hypothetical protein  23.98 
 
 		 260 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84165  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0490  hypothetical protein  23.98 
 
 		 260 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.45051  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36270  predicted multitransmembrane protein  21.72 
 
 		 484 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2506  YibE/F family protein  23.65 
 
 		 406 aa  49.7  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.416194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4623  YibE/F family protein  23.08 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0949625  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0460  YibE/F family protein  28.81 
 
 		 563 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0111  multitransmembrane protein  29.75 
 
 		 253 aa  47.4  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000423826 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2084  YibE/F family protein  22.55 
 
 		 446 aa  47  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0158953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0532  YibE/F family protein  26.27 
 
 		 449 aa  47  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155623  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0281  YibE/F family protein  27.2 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715715  normal  0.837418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0444  YibE/F family protein  25.42 
 
 		 448 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.701723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1474  YibE/F family protein  29.6 
 
 		 345 aa  44.3  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.649458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5754  YibE/F family protein  27.03 
 
 		 404 aa  43.5  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>