More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0395 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  100 
 
 		 157 aa  322  1e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  67.81 
 
 		 155 aa  214  2.9999999999999998e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  67.36 
 
 		 154 aa  213  8e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1302  SsrA-binding protein  63.38 
 
 		 151 aa  199  9.999999999999999e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000931328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  65.03 
 
 		 155 aa  198  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  65.03 
 
 		 155 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  65.03 
 
 		 155 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  65.03 
 
 		 155 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1883  SsrA-binding protein  62.59 
 
 		 155 aa  194  4.0000000000000005e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.254908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  64.34 
 
 		 155 aa  193  9e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  63.64 
 
 		 155 aa  193  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  63.64 
 
 		 155 aa  192  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  63.64 
 
 		 155 aa  192  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  63.64 
 
 		 155 aa  192  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  63.64 
 
 		 155 aa  192  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  63.64 
 
 		 155 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  63.64 
 
 		 155 aa  192  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  57.79 
 
 		 155 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  61.54 
 
 		 155 aa  187  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  62.24 
 
 		 157 aa  186  8e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  58.33 
 
 		 154 aa  186  9e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1725  SsrA-binding protein  57.05 
 
 		 154 aa  185  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  56.08 
 
 		 160 aa  183  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  59.24 
 
 		 158 aa  183  9e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  59.03 
 
 		 161 aa  181  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  56.13 
 
 		 156 aa  177  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  55.41 
 
 		 160 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  57.43 
 
 		 151 aa  177  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  57.43 
 
 		 159 aa  177  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  56.08 
 
 		 159 aa  177  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  57.53 
 
 		 155 aa  177  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  57.53 
 
 		 155 aa  177  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  55.56 
 
 		 154 aa  177  7e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  59.44 
 
 		 156 aa  177  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  55.48 
 
 		 155 aa  176  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  52.6 
 
 		 155 aa  176  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  52.53 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  54.11 
 
 		 158 aa  175  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  54.84 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  58.57 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  54.84 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  54.97 
 
 		 158 aa  174  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  55.86 
 
 		 153 aa  174  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  55.77 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  52.74 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  55.41 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  53.25 
 
 		 157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  53.38 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  53.47 
 
 		 154 aa  171  5e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 162 aa  171  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  52.35 
 
 		 154 aa  170  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  54.23 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  54.23 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  55.24 
 
 		 150 aa  166  9e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2766  SsrA-binding protein  53.52 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  52.67 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  51.33 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  52.05 
 
 		 152 aa  165  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  52.45 
 
 		 162 aa  166  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  51.02 
 
 		 159 aa  164  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  55.94 
 
 		 161 aa  164  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  53.79 
 
 		 172 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  51.02 
 
 		 159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 160 aa  164  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 161 aa  163  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  53.15 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521346  normal  0.65027 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  52.45 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  53.1 
 
 		 153 aa  161  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  53.96 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  53.1 
 
 		 150 aa  161  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  53.1 
 
 		 150 aa  161  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  51.28 
 
 		 158 aa  160  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  53.42 
 
 		 151 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  53.38 
 
 		 159 aa  160  7e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 156 aa  160  9e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  49.35 
 
 		 165 aa  160  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25160  SsrA-binding protein  50 
 
 		 176 aa  159  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1247  SsrA-binding protein  49.03 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  52.41 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0867  SsrA-binding protein  52.41 
 
 		 176 aa  158  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.609087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5790  SsrA-binding protein  55.41 
 
 		 158 aa  158  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.84107  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  55.17 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  50.32 
 
 		 167 aa  158  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  52.11 
 
 		 157 aa  157  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  49.36 
 
 		 161 aa  157  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  56.43 
 
 		 157 aa  156  8e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  50 
 
 		 157 aa  156  9e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 155 aa  156  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  48.7 
 
 		 165 aa  156  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  52.11 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0962  SsrA-binding protein  50 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2620  SsrA-binding protein  48.08 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1198  SsrA-binding protein  52.41 
 
 		 189 aa  155  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  50 
 
 		 157 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  51.39 
 
 		 157 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1709  SsrA-binding protein  48.7 
 
 		 164 aa  154  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>