More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0385 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 453 aa  897    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  50.34 
 
 		 443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  51.03 
 
 		 435 aa  404  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  50.8 
 
 		 437 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  50.46 
 
 		 438 aa  393  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  50.46 
 
 		 438 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  50.46 
 
 		 438 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  50.46 
 
 		 438 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  50.46 
 
 		 438 aa  391  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  50.46 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  50.69 
 
 		 437 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  50.92 
 
 		 437 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  42.66 
 
 		 443 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  49.21 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  38.99 
 
 		 440 aa  267  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  38.99 
 
 		 440 aa  267  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  38.46 
 
 		 452 aa  247  2e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  34.93 
 
 		 442 aa  236  9e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  33.03 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  31.37 
 
 		 485 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  29.34 
 
 		 440 aa  171  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  26.46 
 
 		 522 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  27.62 
 
 		 445 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  31.48 
 
 		 462 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  31.48 
 
 		 462 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  31.39 
 
 		 439 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  31.95 
 
 		 445 aa  160  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.473347 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  31.95 
 
 		 445 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  31.95 
 
 		 445 aa  160  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  31.95 
 
 		 445 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  30.32 
 
 		 489 aa  160  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  31.45 
 
 		 462 aa  159  8e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  31.95 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  28.86 
 
 		 452 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0924  amino acid permease-associated region  26.41 
 
 		 449 aa  150  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.200497  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 		 469 aa  146  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  29.24 
 
 		 473 aa  146  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  26 
 
 		 473 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  26.81 
 
 		 467 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  26.15 
 
 		 474 aa  143  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2592  amino acid permease-associated region  27.75 
 
 		 452 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000351303  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  28.17 
 
 		 495 aa  140  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  26.59 
 
 		 444 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1589  amino acid permease, putative  29.83 
 
 		 450 aa  139  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000140221  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0128  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000357804  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  25.87 
 
 		 499 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  28.33 
 
 		 472 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  26.37 
 
 		 484 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  28.57 
 
 		 480 aa  126  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  26.02 
 
 		 609 aa  126  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  27.4 
 
 		 482 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  26.17 
 
 		 448 aa  121  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  24.75 
 
 		 458 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  26.73 
 
 		 447 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  26.47 
 
 		 463 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 427 aa  119  7.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  23.58 
 
 		 580 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  26.39 
 
 		 512 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  25.22 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 		 463 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  25.62 
 
 		 426 aa  111  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  29.24 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 		 490 aa  107  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 		 770 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  27.88 
 
 		 753 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00403  Amino acid permease-associated region  25.34 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.613152  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 		 429 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2909  amino acid permease-associated region  25.44 
 
 		 452 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13469 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  24.21 
 
 		 447 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2279  amino acid permease-associated region  26.74 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665264  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  22.97 
 
 		 489 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  28.33 
 
 		 745 aa  99.4  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 485 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 		 436 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5065  amino acid permease-associated region  24.88 
 
 		 457 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  24.88 
 
 		 764 aa  95.9  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  24.36 
 
 		 471 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  26.1 
 
 		 441 aa  94.7  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  25.69 
 
 		 506 aa  95.1  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  25.34 
 
 		 471 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  25.62 
 
 		 471 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  25.62 
 
 		 471 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  25.62 
 
 		 471 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  28.06 
 
 		 445 aa  94.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  24.83 
 
 		 491 aa  94.4  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08538  amino acid transporter (Eurofung)  25.82 
 
 		 507 aa  94  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 471 aa  94  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 		 460 aa  94  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.35 
 
 		 494 aa  94  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  25.39 
 
 		 452 aa  94  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  24.28 
 
 		 483 aa  93.6  7e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0421  amino acid permease family protein  24.55 
 
 		 430 aa  92.8  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  27.88 
 
 		 495 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  27.96 
 
 		 466 aa  92.8  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  27.94 
 
 		 543 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  25.54 
 
 		 786 aa  92  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  29.08 
 
 		 544 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  23.97 
 
 		 481 aa  92.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  29.08 
 
 		 576 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>