More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0346 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0346  glutamate 5-kinase  100 
 
 
262 aa  534  1e-151  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1717  gamma-glutamyl kinase  54.09 
 
 
270 aa  285  5.999999999999999e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1676  gamma-glutamyl kinase  52.34 
 
 
267 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0283  gamma-glutamyl kinase  51.36 
 
 
267 aa  275  5e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2904  gamma-glutamyl kinase  50.2 
 
 
269 aa  261  6e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2583  gamma-glutamyl kinase  49.8 
 
 
269 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2877  gamma-glutamyl kinase  48.64 
 
 
272 aa  249  5e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.518001  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1766  gamma-glutamyl kinase  47.47 
 
 
277 aa  245  6e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000141606  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0947  glutamate 5-kinase  48.83 
 
 
268 aa  241  6e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0230243  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1645  glutamate 5-kinase  45.7 
 
 
266 aa  214  9e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0294  glutamate 5-kinase  46.12 
 
 
262 aa  212  4.9999999999999996e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.144372  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  43.36 
 
 
373 aa  211  5.999999999999999e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2603  glutamate 5-kinase  44.44 
 
 
282 aa  211  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  43.19 
 
 
372 aa  209  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  42.97 
 
 
373 aa  209  5e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  40.15 
 
 
387 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  46.27 
 
 
369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  41.63 
 
 
390 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  39.31 
 
 
373 aa  196  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  46.3 
 
 
367 aa  196  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2415  gamma-glutamyl kinase  41.18 
 
 
375 aa  194  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0941339  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  44.62 
 
 
373 aa  193  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0481  gamma-glutamyl kinase  41.83 
 
 
406 aa  192  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  44.4 
 
 
367 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  45.74 
 
 
376 aa  189  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  42.97 
 
 
369 aa  188  7e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  41.09 
 
 
375 aa  188  7e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  39.76 
 
 
376 aa  188  9e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  38.67 
 
 
374 aa  186  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  43.58 
 
 
369 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  43.58 
 
 
369 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  41.54 
 
 
373 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2251  gamma-glutamyl kinase  37.98 
 
 
367 aa  185  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00921401  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  42.75 
 
 
373 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3029  gamma-glutamyl kinase  37.98 
 
 
367 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0863421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2994  gamma-glutamyl kinase  37.98 
 
 
367 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.13461  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  40.47 
 
 
374 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2782  gamma-glutamyl kinase  37.6 
 
 
386 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2731  gamma-glutamyl kinase  37.6 
 
 
367 aa  180  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.681292  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2712  gamma-glutamyl kinase  37.6 
 
 
386 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2993  gamma-glutamyl kinase  37.6 
 
 
367 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0371312  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  39 
 
 
383 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  41.57 
 
 
373 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2989  gamma-glutamyl kinase  37.6 
 
 
414 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2010  glutamate 5-kinase  36.86 
 
 
382 aa  179  5.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00026672  hitchhiker  0.000000000000558815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2790  gamma-glutamyl kinase  36.82 
 
 
367 aa  178  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.558621  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  42.97 
 
 
373 aa  178  9e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  41.8 
 
 
372 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  39.22 
 
 
378 aa  176  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  40 
 
 
373 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  39.77 
 
 
376 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  39.77 
 
 
376 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  42.57 
 
 
373 aa  174  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  42.02 
 
 
373 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0196  gamma-glutamyl kinase  42.69 
 
 
360 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00572245  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  37.8 
 
 
375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2457  glutamate 5-kinase  43.4 
 
 
374 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0853623 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  40.08 
 
 
372 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  38.98 
 
 
370 aa  172  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2164  gamma-glutamyl kinase  44.09 
 
 
373 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.587053 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  38.46 
 
 
390 aa  172  5e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08281  gamma-glutamyl kinase  42.69 
 
 
360 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.269523 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  39.38 
 
 
372 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2872  gamma-glutamyl kinase  40.31 
 
 
374 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  42.21 
 
 
367 aa  171  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  38.37 
 
 
372 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  37.74 
 
 
369 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  38.37 
 
 
374 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  42.02 
 
 
393 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  38.76 
 
 
369 aa  169  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2016  gamma-glutamyl kinase  40.54 
 
 
374 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131983  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0456  glutamate 5-kinase  40 
 
 
381 aa  169  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0927059  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  37.69 
 
 
373 aa  169  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07931  gamma-glutamyl kinase  38.76 
 
 
360 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0215  glutamate 5-kinase  37.98 
 
 
260 aa  169  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.256743 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3028  gamma-glutamyl kinase  38.05 
 
 
353 aa  168  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0223957  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  37.84 
 
 
392 aa  168  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  38.31 
 
 
368 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  39.38 
 
 
372 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1096  gamma-glutamyl kinase  39.54 
 
 
362 aa  166  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.510371  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0197  glutamate 5-kinase  37.4 
 
 
260 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.670063  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  38.93 
 
 
377 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  40.08 
 
 
372 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  39.22 
 
 
366 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08491  gamma-glutamyl kinase  38.55 
 
 
360 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.768779  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  35.94 
 
 
376 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4269  gamma-glutamyl kinase  39.06 
 
 
365 aa  165  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08521  gamma-glutamyl kinase  38.55 
 
 
360 aa  165  9e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  38.37 
 
 
372 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  38.61 
 
 
372 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  39 
 
 
372 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  39 
 
 
372 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  38.37 
 
 
379 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  33.2 
 
 
376 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  37.11 
 
 
374 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  37.21 
 
 
372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  37.21 
 
 
372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1683  gamma-glutamyl kinase  37.64 
 
 
359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0321844  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1575  gamma-glutamyl kinase  37.98 
 
 
363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730383 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  37.21 
 
 
372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>