More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0330 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  100 
 
 		 213 aa  435  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  55.29 
 
 		 210 aa  244  9e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  55.07 
 
 		 213 aa  242  3.9999999999999997e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  54.07 
 
 		 214 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  51.2 
 
 		 208 aa  226  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  51.2 
 
 		 208 aa  226  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  51.2 
 
 		 208 aa  226  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  51.2 
 
 		 208 aa  226  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  51.2 
 
 		 208 aa  226  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  51.2 
 
 		 208 aa  225  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  51.2 
 
 		 208 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 208 aa  224  9e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 208 aa  223  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  50.23 
 
 		 211 aa  223  2e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 208 aa  222  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  47.85 
 
 		 208 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  53.85 
 
 		 213 aa  217  1e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  54.04 
 
 		 209 aa  215  4e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  50 
 
 		 211 aa  214  7e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  49.3 
 
 		 217 aa  214  7e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 205 aa  206  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 205 aa  206  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 203 aa  204  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  44.62 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  45.79 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  43.48 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  43.27 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  43.13 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  43.01 
 
 		 213 aa  167  7e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  40.19 
 
 		 686 aa  165  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  41.5 
 
 		 686 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  42.29 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  41.23 
 
 		 224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  40.61 
 
 		 234 aa  161  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  41.95 
 
 		 210 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  39.42 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  41.95 
 
 		 205 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  44.19 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  40.48 
 
 		 216 aa  158  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  40.19 
 
 		 901 aa  158  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  41.18 
 
 		 211 aa  158  7e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  38.28 
 
 		 671 aa  157  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  41.44 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  41.46 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  42.35 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  38.83 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  39.13 
 
 		 221 aa  155  6e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  40.89 
 
 		 213 aa  154  7e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  42.93 
 
 		 210 aa  154  7e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  40.28 
 
 		 232 aa  154  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  42.57 
 
 		 225 aa  154  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  40 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  40.78 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  38.39 
 
 		 688 aa  153  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  44.62 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  42.35 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  37.8 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  39.13 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  41.29 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  40.82 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  41.95 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  39.91 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  41.46 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  42.13 
 
 		 210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  40.59 
 
 		 211 aa  151  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  41.12 
 
 		 210 aa  151  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  41.09 
 
 		 218 aa  151  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  38.1 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  43.94 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  37.91 
 
 		 707 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  39.52 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  39.61 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  42.64 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  40.09 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  39.41 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  40 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1870  thymidylate kinase  44.02 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  38.03 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  38.57 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  41.71 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  40 
 
 		 206 aa  148  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  38.86 
 
 		 217 aa  148  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  42.03 
 
 		 210 aa  148  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  39.61 
 
 		 210 aa  147  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  37.5 
 
 		 209 aa  147  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  36.8 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  38.24 
 
 		 703 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  41.87 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  36.97 
 
 		 212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  40 
 
 		 216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  36.97 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  39.37 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  39.52 
 
 		 281 aa  145  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  41.55 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  37.62 
 
 		 214 aa  145  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  41.92 
 
 		 209 aa  145  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  39.32 
 
 		 202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  38.54 
 
 		 234 aa  144  8.000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  39.89 
 
 		 688 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  39.59 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>