More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0310 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  83.12 
 
 		 397 aa  683    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 397 aa  814    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 395 aa  383  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 395 aa  379  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 395 aa  363  3e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  41.79 
 
 		 400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  42.05 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  43.54 
 
 		 400 aa  344  2e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 393 aa  343  4e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  43.29 
 
 		 417 aa  338  9e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  43.8 
 
 		 397 aa  336  3.9999999999999995e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  42.35 
 
 		 395 aa  334  2e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 383 aa  332  5e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 340 aa  328  8e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  41.62 
 
 		 394 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 393 aa  322  6e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  42.16 
 
 		 399 aa  321  9.999999999999999e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 399 aa  321  9.999999999999999e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  41.49 
 
 		 404 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  40.92 
 
 		 406 aa  319  7e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  41.39 
 
 		 393 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  41.39 
 
 		 393 aa  316  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  40.62 
 
 		 393 aa  315  8e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 403 aa  315  9e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 399 aa  315  9.999999999999999e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  43.81 
 
 		 406 aa  315  9.999999999999999e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  40.25 
 
 		 396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  40.25 
 
 		 396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  40.87 
 
 		 393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  40.56 
 
 		 398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  39.49 
 
 		 386 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  40.56 
 
 		 398 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  40.87 
 
 		 393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 395 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  40.87 
 
 		 393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  41.52 
 
 		 394 aa  307  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  38.07 
 
 		 463 aa  306  4.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  42.05 
 
 		 377 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  37.28 
 
 		 401 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  40.62 
 
 		 393 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  40.62 
 
 		 393 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  40.62 
 
 		 393 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  40.62 
 
 		 393 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  40.62 
 
 		 393 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  40.62 
 
 		 393 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  42.18 
 
 		 400 aa  298  9e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  38.78 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  37.69 
 
 		 394 aa  295  9e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 386 aa  295  9e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  39.95 
 
 		 409 aa  295  1e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  38.62 
 
 		 401 aa  293  3e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  39.19 
 
 		 433 aa  293  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 406 aa  291  9e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  36.13 
 
 		 439 aa  288  8e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 401 aa  286  2.9999999999999996e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 450 aa  286  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 393 aa  285  8e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  37.91 
 
 		 394 aa  285  9e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  36.83 
 
 		 446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 416 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  42.06 
 
 		 406 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  37.28 
 
 		 440 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  39.18 
 
 		 517 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  38.71 
 
 		 420 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  36.2 
 
 		 397 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  36.06 
 
 		 437 aa  282  9e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 407 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  36.48 
 
 		 611 aa  279  7e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  35.1 
 
 		 446 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  35.62 
 
 		 438 aa  277  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3585  putative transcriptional regulator, GntR family  41.13 
 
 		 410 aa  276  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.06961  normal  0.158236 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  37.28 
 
 		 395 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  37.91 
 
 		 404 aa  276  4e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  36.48 
 
 		 436 aa  276  7e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  35.28 
 
 		 405 aa  275  8e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  37.24 
 
 		 402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  36.86 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  37.24 
 
 		 402 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  39.15 
 
 		 405 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 441 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  39.04 
 
 		 410 aa  273  5.000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  39.04 
 
 		 410 aa  272  9e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  37.85 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1642  aminotransferase class I and II  37.95 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  37.06 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  34.97 
 
 		 425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 430 aa  270  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  38.36 
 
 		 407 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0861  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 392 aa  269  7e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.543615  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 441 aa  269  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>