More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0307 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  100 
 
 
180 aa  371  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  7.33893e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0268  transcription antitermination protein nusG  60.54 
 
 
192 aa  234  5e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000582831  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  58.86 
 
 
182 aa  227  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  58.86 
 
 
182 aa  227  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  61.49 
 
 
177 aa  225  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  58.29 
 
 
182 aa  225  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  56.67 
 
 
183 aa  226  2e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1422  transcription antitermination protein nusG  58.66 
 
 
185 aa  224  3e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.002098  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  58.43 
 
 
181 aa  222  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  62.07 
 
 
177 aa  216  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  9.31665e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  54.02 
 
 
175 aa  202  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  6.2864e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  54.6 
 
 
174 aa  201  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  7.27534e-14  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  55.17 
 
 
175 aa  198  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.47395e-09  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  60.92 
 
 
177 aa  196  1e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  9.96375e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2062  transcription antitermination protein NusG  53.67 
 
 
179 aa  196  2e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  54.34 
 
 
175 aa  196  2e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.72103e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0263  transcription antitermination protein NusG  53.67 
 
 
179 aa  195  3e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  2.7375e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 
177 aa  191  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  4.57799e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 
177 aa  191  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  8.09778e-09  unclonable  4.06083e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 
177 aa  191  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.81772e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 
177 aa  191  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.09294e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 
177 aa  191  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 
177 aa  191  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  2.61698e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 
177 aa  191  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.76433e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 
177 aa  191  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  8.63076e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 
177 aa  191  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.32326e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  51.12 
 
 
173 aa  185  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  2.31541e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  54.86 
 
 
175 aa  184  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  1.00106e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  51.12 
 
 
173 aa  185  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  1.34964e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  49.43 
 
 
187 aa  183  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  51.45 
 
 
178 aa  183  1e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  51.43 
 
 
172 aa  182  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.55754e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  51.72 
 
 
176 aa  181  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.96245e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  50 
 
 
203 aa  180  8e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  52.02 
 
 
175 aa  179  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.33733e-06  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  49.17 
 
 
181 aa  180  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  3.24122e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  48.57 
 
 
177 aa  176  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  50.57 
 
 
178 aa  176  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  2.31337e-05 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  47.98 
 
 
194 aa  173  1e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  48.89 
 
 
177 aa  173  1e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  49.41 
 
 
188 aa  172  2e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  46.63 
 
 
266 aa  172  3e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  48.33 
 
 
177 aa  172  3e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  46.82 
 
 
194 aa  171  6e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  48.33 
 
 
177 aa  170  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  1.69889e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  45.05 
 
 
306 aa  170  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  44.81 
 
 
266 aa  169  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  46.37 
 
 
238 aa  168  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  46.37 
 
 
250 aa  168  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  43.68 
 
 
272 aa  166  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2406  transcription antitermination protein NusG  46.59 
 
 
185 aa  166  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337578  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  48.3 
 
 
176 aa  166  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  43.81 
 
 
267 aa  165  3e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  45.41 
 
 
280 aa  165  3e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  48.88 
 
 
178 aa  165  3e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  1.9364e-08 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  48.89 
 
 
181 aa  165  3e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  3.64949e-09  unclonable  2.28976e-08 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  46.59 
 
 
174 aa  165  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  9.07525e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  41.67 
 
 
272 aa  164  7e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  45.3 
 
 
277 aa  164  9e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  42.19 
 
 
266 aa  163  1e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  41.62 
 
 
238 aa  162  2e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  44.75 
 
 
273 aa  162  2e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  43.82 
 
 
242 aa  162  2e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  43.82 
 
 
242 aa  162  2e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  45 
 
 
246 aa  161  5e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  44.19 
 
 
201 aa  161  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  42.19 
 
 
299 aa  160  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  41.03 
 
 
276 aa  159  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  45.3 
 
 
185 aa  159  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  40.84 
 
 
270 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  40.84 
 
 
270 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  40.84 
 
 
271 aa  157  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  44.2 
 
 
185 aa  155  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0695  transcription termination/antitermination factor NusG  44.33 
 
 
317 aa  156  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  46.07 
 
 
228 aa  156  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0909  NusG antitermination factor  46.96 
 
 
262 aa  155  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269153  normal  0.196956 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  42.02 
 
 
273 aa  154  7e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2954  NusG antitermination factor  40.53 
 
 
198 aa  153  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  2.49386e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  41.75 
 
 
265 aa  153  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  43.16 
 
 
273 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5965  NusG antitermination factor  39.58 
 
 
269 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.981962 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  43.93 
 
 
172 aa  152  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.3421e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0635  transcription antitermination protein NusG  42.39 
 
 
205 aa  151  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0471778  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  42.11 
 
 
173 aa  151  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  41.57 
 
 
176 aa  151  6e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1532  NusG antitermination factor  41.34 
 
 
174 aa  150  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  5.37782e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  42.86 
 
 
177 aa  149  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.80311e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  43.43 
 
 
185 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  43.43 
 
 
185 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  7.649e-05  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  43.43 
 
 
185 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  43.43 
 
 
185 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  43.43 
 
 
185 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  43.43 
 
 
185 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  43.43 
 
 
185 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  40.8 
 
 
177 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  42.37 
 
 
185 aa  148  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  8.22613e-07 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  42.37 
 
 
185 aa  148  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  42.86 
 
 
185 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  7.38018e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  42.37 
 
 
185 aa  148  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  42.86 
 
 
185 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>