More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0271 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 508 aa  1043    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  63.86 
 
 		 494 aa  644    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0280  lysyl-tRNA synthetase  66.94 
 
 		 504 aa  686    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0337786  hitchhiker  0.000160762 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0406  lysyl-tRNA synthetase  67.48 
 
 		 495 aa  678    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  63.86 
 
 		 496 aa  630  1e-179  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0190  lysyl-tRNA synthetase (class II)  62.22 
 
 		 496 aa  630  1e-179  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  61.99 
 
 		 496 aa  617  1e-175  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  59.26 
 
 		 494 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  57.82 
 
 		 494 aa  592  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  58.91 
 
 		 515 aa  593  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  58.91 
 
 		 515 aa  593  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  58.44 
 
 		 499 aa  589  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  57.29 
 
 		 495 aa  585  1e-166  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  58.64 
 
 		 499 aa  585  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  58.85 
 
 		 499 aa  586  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  58.85 
 
 		 499 aa  586  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  58.85 
 
 		 499 aa  586  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  58.64 
 
 		 499 aa  585  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  58.85 
 
 		 499 aa  586  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  58.85 
 
 		 499 aa  587  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  58.23 
 
 		 499 aa  580  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  58.23 
 
 		 499 aa  580  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  58.23 
 
 		 499 aa  579  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  58.16 
 
 		 495 aa  570  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 491 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  56 
 
 		 499 aa  557  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 		 493 aa  550  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  56.58 
 
 		 499 aa  547  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 497 aa  548  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 		 488 aa  543  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 489 aa  535  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 		 631 aa  534  1e-150  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 503 aa  532  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  52.67 
 
 		 499 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 		 489 aa  523  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 501 aa  524  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 501 aa  523  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 510 aa  522  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl030  lysyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 		 499 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 		 490 aa  517  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 		 505 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 573 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0836  lysyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 500 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  50.89 
 
 		 573 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 		 647 aa  503  1e-141  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 		 1118 aa  503  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 489 aa  502  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  50.71 
 
 		 505 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 505 aa  499  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 		 509 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  50.71 
 
 		 505 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  50.61 
 
 		 499 aa  499  1e-140  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 505 aa  498  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 505 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 505 aa  498  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 505 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 505 aa  498  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 		 494 aa  493  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 561 aa  494  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 505 aa  494  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 496 aa  491  9.999999999999999e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 505 aa  489  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 504 aa  489  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 505 aa  488  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 505 aa  487  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0797  lysyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 509 aa  486  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0164991 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1034  lysyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 515 aa  485  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 503 aa  488  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 573 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  50.1 
 
 		 505 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 505 aa  484  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 505 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 505 aa  484  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0640  lysyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 496 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 505 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 505 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 505 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 505 aa  484  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 505 aa  483  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 512 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 505 aa  484  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0480  lysyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 496 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 505 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  50.1 
 
 		 505 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 505 aa  484  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 505 aa  484  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 504 aa  482  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 505 aa  484  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 502 aa  481  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 509 aa  479  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1472  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 514 aa  478  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 496 aa  476  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 510 aa  476  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 502 aa  477  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0883  lysyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 505 aa  478  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 505 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  48.89 
 
 		 771 aa  477  1e-133  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 502 aa  478  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 505 aa  478  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3851  lysyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 505 aa  478  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0982146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>