More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0247 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0062  transposase IS200-family protein  100 
 
 
152 aa  318  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.121759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0247  transposase IS200-family protein  100 
 
 
152 aa  318  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0496  transposase IS200-family protein  100 
 
 
152 aa  318  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000245422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0689  transposase IS200-family protein  100 
 
 
152 aa  318  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000314281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0725  transposase IS200-family protein  100 
 
 
152 aa  318  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000160762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  100 
 
 
152 aa  318  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  100 
 
 
152 aa  318  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  100 
 
 
152 aa  318  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  100 
 
 
152 aa  318  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  100 
 
 
152 aa  318  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1499  transposase IS200-family protein  100 
 
 
152 aa  318  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000001093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1892  transposase IS200-family protein  100 
 
 
152 aa  318  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0977  transposase IS200-family protein  99.34 
 
 
152 aa  316  7.999999999999999e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0423  transposase IS200-family protein  99.34 
 
 
152 aa  315  1e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1820  transposase IS200-family protein  77.48 
 
 
154 aa  263  5.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1668  transposase IS200-family protein  77.48 
 
 
154 aa  263  5.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2133  transposase IS200-family protein  77.48 
 
 
154 aa  263  5.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000517117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0748  transposase IS200-family protein  77.48 
 
 
154 aa  263  5.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000554025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2231  transposase IS200-family protein  77.48 
 
 
154 aa  263  5.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  77.48 
 
 
154 aa  263  5.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  77.48 
 
 
151 aa  263  8e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3174  transposase IS200-family protein  75 
 
 
154 aa  255  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0323  transposase IS200-family protein  74.83 
 
 
155 aa  254  4e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287972  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11260  transposase  73.83 
 
 
151 aa  246  5e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2031  transposase IS200-like protein  65.07 
 
 
158 aa  213  5.9999999999999996e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000295785  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1432  transposase IS200-like protein  64.38 
 
 
158 aa  210  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1173  IS200 family transposase  61.18 
 
 
160 aa  208  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  63.01 
 
 
156 aa  207  5e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2240  IS200 family transposase  59.21 
 
 
160 aa  202  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3832  transposase IS200-family protein  65.31 
 
 
200 aa  201  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000495422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2998  transposase IS200-family protein  60.54 
 
 
156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000570357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0382  IS1469, transposase  57.24 
 
 
151 aa  188  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3814  IS1541 transposase  51.37 
 
 
169 aa  166  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0736  IS1541 transposase  51.37 
 
 
169 aa  166  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0335566  normal  0.0282263 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1222  IS1541 transposase  51.37 
 
 
169 aa  166  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1356  transposase  51.37 
 
 
152 aa  166  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.307018 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1045  transposase  51.37 
 
 
152 aa  166  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2658  transposase  51.37 
 
 
152 aa  166  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81443  hitchhiker  0.00656251 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3810  IS1541 transposase  51.37 
 
 
169 aa  166  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4874  transposase  51.37 
 
 
152 aa  166  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.110034  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1945  IS1541 transposase  51.37 
 
 
169 aa  166  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000772638  normal  0.100014 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3075  IS1541 transposase  51.37 
 
 
169 aa  166  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0327  IS1541 transposase  51.37 
 
 
169 aa  166  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000467604  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1048  transposase  51.37 
 
 
170 aa  166  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0777104  normal  0.0145737 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3388  IS1541 transposase  51.37 
 
 
169 aa  165  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601978  normal  0.413736 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0363  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0581  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000153282  normal  0.258801 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0407  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000708618  hitchhiker  0.0000208321 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3031  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000139818  normal  0.117471 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0477  transposase for IS200  58.2 
 
 
136 aa  164  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3413  IS1541, transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3858  IS1541, transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1029  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0050  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0116  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3224  IS1541, transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2576  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3124  insertion sequence transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000108202  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3020  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0134798 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2930  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0786  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.282171 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1827  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1993  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0793  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365288  normal  0.44998 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3905  IS1541, transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000085189  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1138  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.130419  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2539  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2455  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2812  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.67972 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3359  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.766936 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2283  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1100  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1297  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0680  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0029  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3065  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2613  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0181  IS1541, transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0496  IS1541, transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1673  IS1541, transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00131139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1725  IS1541, transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.72362  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2543  IS1541, transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.8293000000000004e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2995  transposase IS200-family protein  50.68 
 
 
152 aa  164  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0617  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000906641  normal  0.0356366 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0846  transposase IS200-family protein  50.68 
 
 
152 aa  164  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3488  transposase IS200-family protein  50.68 
 
 
152 aa  164  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0333  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000846816  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2533  transposase IS200-family protein  50.68 
 
 
152 aa  164  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1972  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3506  transposase IS200-family protein  50.68 
 
 
152 aa  164  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00621529  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1679  transposase IS200-family protein  50.68 
 
 
152 aa  164  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1554  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2227  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835855  hitchhiker  0.00464434 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0809  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0253  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000556152  hitchhiker  0.00000156199 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0340  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0119674  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1992  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0847  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.870119  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3869  IS1541, transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000363831  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2469  IS1541 transposase  50.68 
 
 
169 aa  164  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.627217  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>