177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0246 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0246  glutaminase  100 
 
 
313 aa  642    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000116675  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0507  glutaminase  48.51 
 
 
306 aa  290  3e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1254  L-glutaminase  46.03 
 
 
306 aa  270  2e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0571  glutaminase  42.33 
 
 
307 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0557  glutaminase  42 
 
 
307 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  38.74 
 
 
305 aa  209  4e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  38.74 
 
 
305 aa  209  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  33.33 
 
 
306 aa  176  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2961  glutaminase  32.89 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0426  glutaminase  32.57 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000693628  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2044  glutaminase  33.67 
 
 
307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0414  glutaminase  32.11 
 
 
309 aa  162  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000025535  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25660  L-glutaminase  35.42 
 
 
333 aa  162  8.000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0553  glutaminase  32.11 
 
 
309 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00275922  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0555  glutaminase  32.11 
 
 
309 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000637393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0471  glutaminase  32.11 
 
 
309 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.233073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0410  glutaminase  32.11 
 
 
309 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0499  glutaminase  32.11 
 
 
309 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0044437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0480  glutaminase  32.11 
 
 
309 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0502  glutaminase  32.11 
 
 
309 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4820  glutaminase  32.11 
 
 
309 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404932  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0416  glutaminase  32.11 
 
 
309 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00235106  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2048  glutaminase  33.44 
 
 
306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3725  glutaminase  33.9 
 
 
309 aa  146  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1383  glutaminase  32.13 
 
 
311 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  31.7 
 
 
311 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37730  L-glutaminase  32.48 
 
 
338 aa  142  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.89769  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09673  glutaminase  31.89 
 
 
304 aa  142  7e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.200961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2097  glutaminase  31.63 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851377  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2652  glutaminase  32.35 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1969  Glutaminase  32.46 
 
 
318 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2155  glutaminase  31.79 
 
 
309 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948088 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2907  glutaminase  31.31 
 
 
326 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0924561  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1541  glutaminase  29.53 
 
 
309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345343  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2375  glutaminase  32.76 
 
 
309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188361  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3164  glutaminase  31.31 
 
 
326 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.566002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1550  cyclic nucleotide-binding protein  29.73 
 
 
613 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3142  glutaminase  31.31 
 
 
326 aa  139  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2932  glutaminase  30.99 
 
 
326 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2857  glutaminase  30.99 
 
 
326 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.872371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3155  glutaminase  30.99 
 
 
326 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  31.47 
 
 
601 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3795  glutaminase  33.9 
 
 
303 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0198584  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3171  glutaminase  30.99 
 
 
326 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  32.19 
 
 
309 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2331  glutaminase  31.03 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4729  glutaminase  30.61 
 
 
311 aa  136  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1330  glutaminase  31.71 
 
 
306 aa  136  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.957887  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1322  glutaminase  32.89 
 
 
304 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.152397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4504  glutaminase  29.27 
 
 
309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  31.48 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  30.54 
 
 
624 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0446  Glutaminase  30.23 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4418  Glutaminase  31.79 
 
 
308 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3446  Glutaminase  33.22 
 
 
343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1928  glutaminase  32.03 
 
 
308 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0822  glutaminase  32.07 
 
 
308 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0823  glutaminase  32.07 
 
 
308 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.963027  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1946  glutaminase  32.38 
 
 
309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0536  glutaminase  30.98 
 
 
306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0006  glutaminase  29.73 
 
 
316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.110164  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2670  Glutaminase  32.31 
 
 
343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  28.71 
 
 
624 aa  132  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0147  glutaminase  32.07 
 
 
308 aa  133  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.00000034467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4570  glutaminase  28.86 
 
 
309 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449204  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3635  glutaminase  29.28 
 
 
306 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3365  glutaminase  31.21 
 
 
304 aa  132  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2488  glutaminase, putative  30 
 
 
302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.347136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2292  glutaminase  29.8 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0498348  decreased coverage  0.0000324531 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43320  glutaminase  29 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.524936  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3926  cyclic nucleotide-binding protein  30.49 
 
 
608 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1183  glutaminase  31.54 
 
 
304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000358411  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1254  glutaminase  31.54 
 
 
304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000302254  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1184  glutaminase  31.54 
 
 
304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000737214  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2697  glutaminase  31.54 
 
 
304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.718556  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  27.12 
 
 
620 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2867  glutaminase  31.8 
 
 
307 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.705763 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2796  glutaminase  29.33 
 
 
318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.394459 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01481  predicted glutaminase  30.33 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01492  hypothetical protein  30.33 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2122  Glutaminase  30.33 
 
 
308 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0470209  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1648  glutaminase  30.33 
 
 
308 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1682  glutaminase  30.33 
 
 
308 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.670417  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1319  Glutaminase  28.67 
 
 
331 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1606  glutaminase  30.33 
 
 
308 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1724  glutaminase  30.33 
 
 
308 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.334681  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2137  glutaminase  30.33 
 
 
308 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.200055  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2134  glutaminase  30.33 
 
 
308 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0977  Glutaminase  31.47 
 
 
304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1328  glutaminase  31.21 
 
 
304 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00785417  hitchhiker  0.00333617 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1810  glutaminase  30 
 
 
308 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3193  glutaminase  31.21 
 
 
304 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.256164  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1126  glutaminase  30.87 
 
 
304 aa  125  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0389369  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0966  glutaminase  30.2 
 
 
334 aa  125  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2870  glutaminase  30.87 
 
 
304 aa  125  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  30.03 
 
 
315 aa  125  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1630  glutaminase  29.67 
 
 
308 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.637067  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1143  glutaminase  30.6 
 
 
304 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.118169 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1788  glutaminase  30.04 
 
 
346 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1697  glutaminase  29.67 
 
 
308 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172096  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>