More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0238 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0238  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
288 aa  593  1e-168  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0467  fructose/tagatose bisphosphate aldolase  71.88 
 
 
305 aa  434  1e-120  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0246198  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0749  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  55.87 
 
 
287 aa  333  1e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000198166  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1876  fructose-bisphosphate aldolase  55.94 
 
 
293 aa  327  1.0000000000000001e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0127  fructose-bisphosphate aldolase  55.24 
 
 
293 aa  321  8e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000349017  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2168  fructose-bisphosphate aldolase  54.3 
 
 
298 aa  319  3.9999999999999996e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00424601  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0136  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  52.8 
 
 
297 aa  304  9.000000000000001e-82  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl644  fructose-biphosphate aldolase  53.85 
 
 
296 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1557  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  52.48 
 
 
288 aa  301  7.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.669513  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1350  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  52.48 
 
 
288 aa  301  7.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.626031  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0396  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  53.41 
 
 
290 aa  301  1e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3683  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  51.44 
 
 
288 aa  297  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328122  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0701  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  52.61 
 
 
289 aa  286  2e-76  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3333  fructose-bisphosphate aldolase  44.06 
 
 
287 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18020  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  45.23 
 
 
284 aa  236  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000218144  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3443  fructose-bisphosphate aldolase  43.62 
 
 
287 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3856  fructose-bisphosphate aldolase  43.06 
 
 
285 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000214667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5458  fructose-bisphosphate aldolase  43.06 
 
 
285 aa  229  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000373957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5465  fructose-bisphosphate aldolase  43.06 
 
 
285 aa  228  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000314411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5184  fructose-bisphosphate aldolase  43.06 
 
 
285 aa  228  6e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000143751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5019  fructose-bisphosphate aldolase  43.06 
 
 
285 aa  228  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.84183e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5035  fructose-bisphosphate aldolase  43.06 
 
 
285 aa  229  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5428  fructose-bisphosphate aldolase  43.06 
 
 
285 aa  228  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2546599999999999e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5580  fructose-bisphosphate aldolase  43.06 
 
 
285 aa  228  6e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000364685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5513  fructose-bisphosphate aldolase  43.06 
 
 
285 aa  228  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000338483  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2161  fructose-bisphosphate aldolase  43.42 
 
 
286 aa  228  8e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2199  fructose-bisphosphate aldolase  43.42 
 
 
286 aa  228  8e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5494  fructose-bisphosphate aldolase  42.7 
 
 
285 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1732  fructose-bisphosphate aldolase  43.06 
 
 
286 aa  226  3e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.321158  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0088  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.75 
 
 
283 aa  226  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000126307  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5133  fructose-bisphosphate aldolase  42.35 
 
 
285 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000244747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3176  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  40.85 
 
 
284 aa  212  7e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142497  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2878  fructose-bisphosphate aldolase  39.45 
 
 
284 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000127011  hitchhiker  0.0000797391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4839  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.4 
 
 
284 aa  206  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.317142  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2404  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  39.01 
 
 
286 aa  205  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2411  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.11 
 
 
284 aa  205  8e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0613985  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3250  hypothetical protein  38.11 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0056  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  40.15 
 
 
287 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.955798  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0609  fructose-bisphosphate aldolase  40.15 
 
 
284 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0057  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  38.3 
 
 
284 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0610638  hitchhiker  0.000350407 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0675  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.28 
 
 
313 aa  188  9e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2873  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class II  37.46 
 
 
307 aa  188  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0621  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  38 
 
 
323 aa  187  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0651  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.28 
 
 
313 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18209  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1456  ketose-bisphosphate aldolase  38.46 
 
 
293 aa  185  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.283423 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0761  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.71 
 
 
330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0614307  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2083  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.57 
 
 
308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0013  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  38.08 
 
 
307 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162404 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2579  tagatose-bisphosphate aldolase  37.37 
 
 
284 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2222  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  35.64 
 
 
311 aa  179  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000908669  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1276  ketose-bisphosphate aldolase  38.46 
 
 
281 aa  179  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.895965  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1995  ketose-bisphosphate aldolase  42.21 
 
 
281 aa  178  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0759  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.36 
 
 
305 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1070  ketose-bisphosphate aldolase  37.85 
 
 
283 aa  177  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2341  fructose-bisphosphate aldolase  37.42 
 
 
307 aa  176  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142507  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  37.03 
 
 
309 aa  175  6e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.643061  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1272  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  35.67 
 
 
311 aa  175  8e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21247  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0616  fructose/tagatose bisphosphate aldolase, class II  37.5 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.128722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0349  fructose-bisphosphate aldolase  35.86 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000191041  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2175  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  38.89 
 
 
288 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3438  ketose-bisphosphate aldolase  37.82 
 
 
281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0588169  hitchhiker  0.000131538 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1089  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.42 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.234641  normal  0.481189 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4035  ketose-bisphosphate aldolase  40.5 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798906 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1967  ketose-bisphosphate aldolase  38.63 
 
 
283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0791296  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0646  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  33.97 
 
 
312 aa  172  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22740  ketose-bisphosphate aldolase  35.19 
 
 
283 aa  171  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0353  fructose-bisphosphate aldolase  35.69 
 
 
325 aa  171  1e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.198569  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1398  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  35.2 
 
 
307 aa  171  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.635947  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2255  ketose-bisphosphate aldolase  36.17 
 
 
280 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000023078 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1918  ketose-bisphosphate aldolase  37.46 
 
 
308 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1325  fructose-bisphosphate aldolase  35.44 
 
 
374 aa  170  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1021  fructose-bisphosphate aldolase  36.31 
 
 
324 aa  169  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0751312  normal  0.0186184 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3364  tagatose-bisphosphate aldolase  35.86 
 
 
284 aa  167  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.884251 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3445  tagatose-bisphosphate aldolase  34.6 
 
 
284 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000433037  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0929  tagatose-bisphosphate aldolase  35.86 
 
 
284 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0982  tagatose-bisphosphate aldolase  35.86 
 
 
284 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0131  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  37.32 
 
 
308 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3578  tagatose-bisphosphate aldolase  34.71 
 
 
292 aa  166  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88183  normal  0.360097 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2962  tagatose-bisphosphate aldolase  38.35 
 
 
285 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1329  fructose-bisphosphate aldolase  36.67 
 
 
324 aa  165  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.569053  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4026  hypothetical protein  40.97 
 
 
286 aa  165  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2253  fructose-bisphosphate aldolase  34.67 
 
 
327 aa  165  9e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0129  hypothetical protein  40.97 
 
 
286 aa  165  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2393  tagatose-bisphosphate aldolase  35.11 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2645  tagatose-bisphosphate aldolase  37.99 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3611  tagatose-bisphosphate aldolase  34.26 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.089723  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3514  tagatose-bisphosphate aldolase  34.26 
 
 
330 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.542304  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1253  fructose-bisphosphate aldolase  36.33 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.750489  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3443  tagatose-bisphosphate aldolase  34.26 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3551  tagatose-bisphosphate aldolase  34.26 
 
 
330 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0285  hypothetical protein  35.54 
 
 
286 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3383  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  36.94 
 
 
283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235658  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3993  hypothetical protein  35.86 
 
 
286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3436  tagatose-bisphosphate aldolase  34.04 
 
 
286 aa  162  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0949  fructose-bisphosphate aldolase  35.1 
 
 
325 aa  161  9e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0554404  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03004  tagatose 6-phosphate aldolase 1, kbaY subunit  34.04 
 
 
286 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4454  tagatose-bisphosphate aldolase  34.04 
 
 
286 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3329  tagatose-bisphosphate aldolase  34.04 
 
 
286 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02955  hypothetical protein  34.04 
 
 
286 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1712  fructose-bisphosphate aldolase  34.89 
 
 
279 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>