14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0228 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0228  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  270  5.000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000249728  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0512  hypothetical protein  30.77 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000116642  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0629  hypothetical protein  32 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0644  hypothetical protein  32 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0261  hypothetical protein  32.58 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2473  hypothetical protein  28.95 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2183  hypothetical protein  29.82 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0284  hypothetical protein  27.64 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00312794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18080  hypothetical protein  28.15 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.792053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3349  hypothetical protein  26.67 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000075195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2411  hypothetical protein  29.17 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000174546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0049  hypothetical protein  28.1 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.016779  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1936  hypothetical protein  27.64 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000001254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4847  Domain of unknown function DUF1934  26.42 
 
 		 143 aa  40.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000272971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>