More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0221 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
329 aa  668    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  73.58 
 
 
327 aa  500  1e-140  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.45 
 
 
317 aa  471  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.14 
 
 
317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.14 
 
 
317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.14 
 
 
317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.14 
 
 
317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.14 
 
 
317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.14 
 
 
317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.14 
 
 
317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.14 
 
 
317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.14 
 
 
317 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.14 
 
 
317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.32 
 
 
315 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.68 
 
 
315 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0873  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.5 
 
 
324 aa  454  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  68.35 
 
 
326 aa  449  1e-125  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0018  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.77 
 
 
322 aa  427  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00325732  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0043  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.45 
 
 
321 aa  427  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.270111  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.46 
 
 
316 aa  421  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.34 
 
 
325 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0138  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.32 
 
 
321 aa  412  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.056526  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.74 
 
 
322 aa  412  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.46 
 
 
314 aa  410  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.23 
 
 
316 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0522  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.35 
 
 
321 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00402651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.9 
 
 
313 aa  404  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0535  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.35 
 
 
321 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0143488  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.38 
 
 
315 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.7 
 
 
319 aa  404  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.31 
 
 
322 aa  398  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.19 
 
 
319 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.38 
 
 
319 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  57.42 
 
 
317 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60 
 
 
318 aa  385  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.68 
 
 
317 aa  382  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.41 
 
 
314 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.45 
 
 
329 aa  364  1e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  58.2 
 
 
312 aa  363  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.56 
 
 
325 aa  360  2e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0609  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.42 
 
 
324 aa  358  6e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1097  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.03 
 
 
324 aa  358  8e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.584149  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0640  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.99 
 
 
318 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00660234  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2630  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
320 aa  355  3.9999999999999996e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0160  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  55.21 
 
 
336 aa  355  5.999999999999999e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.84 
 
 
330 aa  355  8.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.49 
 
 
321 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.99 
 
 
314 aa  354  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.81 
 
 
321 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.78 
 
 
314 aa  353  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.81 
 
 
321 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.72 
 
 
338 aa  351  1e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.35 
 
 
318 aa  350  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.35 
 
 
318 aa  350  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.83 
 
 
327 aa  350  2e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.53 
 
 
321 aa  349  4e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.24 
 
 
315 aa  349  5e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1163  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.24 
 
 
315 aa  348  7e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.285484  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.6 
 
 
316 aa  347  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.31 
 
 
315 aa  347  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.84 
 
 
309 aa  347  2e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.78 
 
 
314 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.76 
 
 
338 aa  346  3e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.55 
 
 
331 aa  345  6e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.7 
 
 
311 aa  344  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.5 
 
 
316 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.29 
 
 
330 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.5 
 
 
316 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.66 
 
 
321 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  55.66 
 
 
321 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0289  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.85 
 
 
317 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0342  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.85 
 
 
317 aa  342  4e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.29 
 
 
316 aa  342  5e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.63 
 
 
325 aa  342  8e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.21 
 
 
314 aa  341  9e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1709  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.42 
 
 
310 aa  341  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347929  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.78 
 
 
319 aa  341  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.18 
 
 
316 aa  340  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2570  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.18 
 
 
315 aa  341  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00338227  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.97 
 
 
316 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.63 
 
 
324 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3689  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.14 
 
 
324 aa  340  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00564575  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1986  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.59 
 
 
315 aa  340  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.675824  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.23 
 
 
320 aa  340  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.55 
 
 
309 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.88 
 
 
314 aa  339  4e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.613362  normal  0.368621 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.88 
 
 
315 aa  339  4e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.55 
 
 
330 aa  339  4e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.29 
 
 
315 aa  338  5.9999999999999996e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767857  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.23 
 
 
332 aa  338  5.9999999999999996e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.69 
 
 
314 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2464  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.27 
 
 
315 aa  338  7e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.162098  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2070  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.27 
 
 
315 aa  338  7e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000481775  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0985  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.87 
 
 
331 aa  338  7e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107036  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
309 aa  338  7e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2184  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.27 
 
 
315 aa  338  7e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.53 
 
 
323 aa  338  7e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0387  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.7 
 
 
316 aa  338  8e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0198132 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1425  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.46 
 
 
323 aa  338  9e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000869959  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.19 
 
 
309 aa  338  9e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>