More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0146 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 228 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0167  phosphoglyceromutase  79.3 
 
 		 230 aa  379  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000351468  hitchhiker  1.89085e-19 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0122  phosphoglycerate mutase  69.53 
 
 		 237 aa  333  1e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  68.47 
 
 		 229 aa  325  5e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1172  phosphoglyceromutase  66.22 
 
 		 230 aa  316  2e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000600648  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1877  phosphoglycerate mutase  66.09 
 
 		 237 aa  312  2.9999999999999996e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0764  phosphoglyceromutase  64 
 
 		 230 aa  310  1e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00177418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0382  phosphoglyceromutase  64.41 
 
 		 233 aa  300  2e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000158112  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1445  phosphoglyceromutase  63.23 
 
 		 227 aa  294  8e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0868062  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0179  phosphoglycerate mutase 1 family  65.47 
 
 		 229 aa  288  4e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00124281  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1264  phosphoglyceromutase  61.26 
 
 		 230 aa  285  2.9999999999999996e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.500435  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  59.56 
 
 		 232 aa  279  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  58.3 
 
 		 250 aa  275  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  58.74 
 
 		 247 aa  275  5e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  58.74 
 
 		 250 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  58.74 
 
 		 250 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  58.22 
 
 		 250 aa  275  6e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  58.22 
 
 		 250 aa  275  6e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 		 249 aa  275  6e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  58.22 
 
 		 250 aa  275  6e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  58.22 
 
 		 250 aa  275  6e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  58.22 
 
 		 250 aa  275  6e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  58.22 
 
 		 250 aa  275  6e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  58.22 
 
 		 250 aa  275  6e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  58.22 
 
 		 250 aa  275  6e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  59.09 
 
 		 250 aa  274  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  57.14 
 
 		 249 aa  274  8e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  59.09 
 
 		 250 aa  274  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  58.64 
 
 		 250 aa  273  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  57.78 
 
 		 250 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  58.37 
 
 		 247 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1072  phosphoglyceromutase  58.56 
 
 		 249 aa  273  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.095004  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  56.89 
 
 		 250 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  56.76 
 
 		 249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  57.85 
 
 		 293 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  57.4 
 
 		 249 aa  272  3e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2442  phosphoglyceromutase  56.44 
 
 		 228 aa  271  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0953  phosphoglyceromutase  58.11 
 
 		 249 aa  271  6e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.197373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2490  phosphoglyceromutase  56.44 
 
 		 228 aa  271  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  57.4 
 
 		 247 aa  270  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1948  phosphoglyceromutase  58.64 
 
 		 229 aa  270  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  58.3 
 
 		 247 aa  270  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  56.82 
 
 		 250 aa  270  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  57.96 
 
 		 248 aa  270  1e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  56.95 
 
 		 247 aa  269  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  58.64 
 
 		 251 aa  269  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  59.55 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  57.85 
 
 		 247 aa  269  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  57.4 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  56.44 
 
 		 250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  57.52 
 
 		 248 aa  268  5.9999999999999995e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1653  phosphoglyceromutase  58.64 
 
 		 229 aa  266  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  59.82 
 
 		 436 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1059  phosphoglycerate mutase 1 family  56.05 
 
 		 229 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  57.27 
 
 		 247 aa  265  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2861  phosphoglyceromutase  57.27 
 
 		 250 aa  265  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  57.27 
 
 		 250 aa  265  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  57.73 
 
 		 247 aa  265  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  57.27 
 
 		 250 aa  265  4e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3765  phosphoglycerate mutase  57.73 
 
 		 240 aa  265  5e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  57.85 
 
 		 248 aa  265  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  55.56 
 
 		 250 aa  265  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  57.85 
 
 		 247 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  57.73 
 
 		 248 aa  264  8e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  56.95 
 
 		 247 aa  264  8e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  54.67 
 
 		 250 aa  264  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  56.82 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  56.82 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  57.73 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  56.95 
 
 		 247 aa  263  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  54.26 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2007  phosphoglyceromutase  55.7 
 
 		 228 aa  263  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  56.82 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  54.22 
 
 		 250 aa  262  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  57.92 
 
 		 248 aa  261  4.999999999999999e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  55.45 
 
 		 247 aa  261  6e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  55.11 
 
 		 234 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  55.61 
 
 		 234 aa  261  8e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  56.82 
 
 		 251 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  56.82 
 
 		 251 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  54.46 
 
 		 249 aa  256  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1794  phosphoglyceromutase  55.2 
 
 		 245 aa  255  5e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.525097  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3265  phosphoglyceromutase  56.36 
 
 		 228 aa  254  9e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.602214  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  56.11 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  56.11 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  56.11 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  56.11 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  56.11 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  56.11 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0772  phosphoglycerate mutase 1 family  51.8 
 
 		 601 aa  254  1.0000000000000001e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  56.11 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2583  phosphoglyceromutase  55.91 
 
 		 245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2442  phosphoglyceromutase  55.45 
 
 		 245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.205182  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2281  phosphoglyceromutase  55.45 
 
 		 245 aa  253  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000568888  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  51.56 
 
 		 253 aa  252  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  54.22 
 
 		 247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2498  phosphoglycerate mutase  52.63 
 
 		 243 aa  252  4.0000000000000004e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.956409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  53.95 
 
 		 247 aa  251  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  55.91 
 
 		 245 aa  251  6e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  55.91 
 
 		 270 aa  251  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>