More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0141 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  65.14 
 
 
495 aa  652    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0026  amidophosphoribosyltransferase  64.78 
 
 
484 aa  664    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0051  amidophosphoribosyltransferase  66.25 
 
 
479 aa  671    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  66.25 
 
 
503 aa  671    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0141  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
484 aa  994    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  62.45 
 
 
506 aa  626  1e-178  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  62.24 
 
 
471 aa  620  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  62.03 
 
 
471 aa  620  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  62.03 
 
 
471 aa  620  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  62.03 
 
 
471 aa  620  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  62.24 
 
 
471 aa  620  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  62.03 
 
 
471 aa  620  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  62.03 
 
 
471 aa  620  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  62.24 
 
 
471 aa  620  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  62.03 
 
 
471 aa  618  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  62.66 
 
 
471 aa  620  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  62.24 
 
 
471 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0724  amidophosphoribosyltransferase  62.07 
 
 
536 aa  602  1.0000000000000001e-171  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0655  amidophosphoribosyltransferase  59.28 
 
 
494 aa  568  1e-161  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1152  amidophosphoribosyltransferase  59.07 
 
 
494 aa  568  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1130  amidophosphoribosyltransferase  59.07 
 
 
494 aa  568  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  58.62 
 
 
470 aa  551  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  57.88 
 
 
470 aa  548  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  53.17 
 
 
480 aa  489  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  51.3 
 
 
475 aa  488  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  51.11 
 
 
477 aa  483  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  51 
 
 
474 aa  482  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  51.11 
 
 
477 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  51.31 
 
 
488 aa  481  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  50.88 
 
 
466 aa  478  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
487 aa  472  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
474 aa  473  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
467 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  50.21 
 
 
514 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  52.71 
 
 
474 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  50.55 
 
 
472 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
475 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  50.97 
 
 
466 aa  466  9.999999999999999e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  48.45 
 
 
468 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  50.88 
 
 
475 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  51.09 
 
 
499 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  50.88 
 
 
481 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
503 aa  464  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  50.66 
 
 
500 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
490 aa  463  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  51.3 
 
 
491 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  47.27 
 
 
475 aa  459  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  51.3 
 
 
491 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  50.44 
 
 
491 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3501  amidophosphoribosyltransferase  49.36 
 
 
509 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
517 aa  457  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
514 aa  457  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
491 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
488 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  46.22 
 
 
482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  48.79 
 
 
469 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1205  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
493 aa  454  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  47.81 
 
 
493 aa  449  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2452  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 
514 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  45.27 
 
 
461 aa  450  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2311  amidophosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
501 aa  451  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
462 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1062  amidophosphoribosyltransferase  46.41 
 
 
486 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.739126  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  48.03 
 
 
472 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  46.05 
 
 
462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1117  amidophosphoribosyltransferase  46.36 
 
 
487 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.981489  normal  0.353735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  48.92 
 
 
500 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2454  amidophosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
487 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  46.93 
 
 
465 aa  444  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0413  amidophosphoribosyltransferase  50.65 
 
 
491 aa  442  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.577853 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  46.83 
 
 
467 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1187  amidophosphoribosyltransferase  48.73 
 
 
496 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  45.75 
 
 
473 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1042  amidophosphoribosyltransferase  48.52 
 
 
496 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  47.58 
 
 
487 aa  442  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3939  amidophosphoribosyltransferase  46.41 
 
 
499 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
484 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0486  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
496 aa  444  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.937235  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1415  amidophosphoribosyltransferase  46.83 
 
 
472 aa  438  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08960  amidophosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
496 aa  440  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
485 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  46.17 
 
 
463 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0578  amidophosphoribosyltransferase  48.09 
 
 
486 aa  438  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  47.25 
 
 
451 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2282  amidophosphoribosyltransferase  49.24 
 
 
503 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.235461  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  47.97 
 
 
502 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  45.53 
 
 
473 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  46.72 
 
 
472 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  47.36 
 
 
465 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  48.68 
 
 
494 aa  435  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
485 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  48.68 
 
 
494 aa  435  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  47.08 
 
 
476 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  47.73 
 
 
500 aa  436  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3787  amidophosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
510 aa  438  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  46.83 
 
 
478 aa  434  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1499  amidophosphoribosyltransferase  48.71 
 
 
529 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338535  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  47.86 
 
 
480 aa  434  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0727  amidophosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
496 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2293  amidophosphoribosyltransferase  49.03 
 
 
504 aa  432  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>