35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0120 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0120  branched-chain amino acid transport  100 
 
 
114 aa  223  9e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000282674  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1796  hypothetical protein  32.67 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1773  hypothetical protein  31.68 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1552  hypothetical protein  31.68 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1563  hypothetical protein  31.68 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.574296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1723  hypothetical protein  31.68 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1600  hypothetical protein  31.68 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.532771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1599  branched-chain amino acid transport  32.35 
 
 
103 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.817749  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1851  hypothetical protein  32.18 
 
 
103 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3601  hypothetical protein  32.18 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1742  hypothetical protein  32.18 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  32.98 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2542  hypothetical protein  26.67 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0310  branched-chain amino acid transport  26.26 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1024  branched-chain amino acid transport  25.25 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0636348  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  26.6 
 
 
116 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1416  branched-chain amino acid transport  28 
 
 
109 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  30.34 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0011  hypothetical protein  27.08 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0011  hypothetical protein  27.08 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1392  branched-chain amino acid transport  31.25 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952567  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0195  branched-chain amino acid transport  27.27 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.392711 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4072  integrase family protein  30.23 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  29.29 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  27.91 
 
 
107 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1604  branched-chain amino acid transport  23.23 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461016  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  22.97 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0850  hypothetical protein  27.38 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000591245  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1242  branched chain amino acid ABC transporter  32.99 
 
 
105 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01820  branched-chain amino acid transport  25.53 
 
 
100 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.300489  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  29.35 
 
 
107 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  29.87 
 
 
108 aa  41.6  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0319  branched-chain amino acid transport  30.61 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000013452  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1743  hypothetical protein  23 
 
 
108 aa  40.4  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00109007  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1720  hypothetical protein  22.55 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000179582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>