144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0112 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0112  phosphopentomutase  100 
 
 		 397 aa  815    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000070678  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2256  phosphopentomutase  59.64 
 
 		 393 aa  478  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2786  phosphopentomutase  57.22 
 
 		 395 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000455105  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3918  phosphopentomutase  56.74 
 
 		 394 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000783591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4220  phosphopentomutase  55.98 
 
 		 394 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000013434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3997  phosphopentomutase  56.23 
 
 		 394 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3828  phosphopentomutase  55.98 
 
 		 394 aa  461  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0706266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3844  phosphopentomutase  55.98 
 
 		 394 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512526  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4309  phosphopentomutase  56.23 
 
 		 394 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0282781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4111  phosphopentomutase  55.98 
 
 		 394 aa  461  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.25334e-34 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4197  phosphopentomutase  55.98 
 
 		 394 aa  461  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00100464  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0368  phosphopentomutase  57.22 
 
 		 393 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4156  phosphopentomutase  55.73 
 
 		 394 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317626  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1040  phosphopentomutase  55.73 
 
 		 394 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000119876  hitchhiker  0.000224801 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1743  phosphopentomutase  54.96 
 
 		 396 aa  437  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0125  phosphopentomutase  54.45 
 
 		 392 aa  435  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0130  phosphopentomutase  54.45 
 
 		 392 aa  435  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0376  phosphopentomutase  54.12 
 
 		 396 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0371  phosphopentomutase  54.12 
 
 		 396 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1077  phosphopentomutase  53.71 
 
 		 403 aa  409  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1001  phosphopentomutase  52.94 
 
 		 411 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0408  phosphopentomutase  52.93 
 
 		 389 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1182  phosphopentomutase  51.6 
 
 		 403 aa  396  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2069  phosphopentomutase  51.6 
 
 		 403 aa  396  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0253086  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1773  phosphopentomutase  50.38 
 
 		 390 aa  391  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1472  phosphopentomutase  52.04 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215441  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6094  phosphopentomutase  50 
 
 		 420 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3205  phosphopentomutase  49.36 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3719  phosphopentomutase  50.64 
 
 		 390 aa  383  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2053  phosphopentomutase  49.49 
 
 		 397 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1500  phosphopentomutase  49.74 
 
 		 389 aa  373  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0037  phosphopentomutase  49.11 
 
 		 391 aa  374  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000700156  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1749  phosphopentomutase  50.25 
 
 		 390 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0140  phosphopentomutase  48.24 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2314  phosphopentomutase  48.8 
 
 		 385 aa  367  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.932975  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1100  phosphopentomutase  48.86 
 
 		 397 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2320  phosphopentomutase  47.84 
 
 		 392 aa  359  4e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000329879  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1791  phosphopentomutase  49.07 
 
 		 392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0758  phosphopentomutase  49.23 
 
 		 390 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0677  phosphopentomutase  47.85 
 
 		 388 aa  355  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1667  phosphopentomutase  45.71 
 
 		 392 aa  353  2.9999999999999997e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.104924  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0781  phosphopentomutase  48.97 
 
 		 390 aa  353  4e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0610  phosphopentomutase  48.65 
 
 		 392 aa  347  3e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1281  phosphopentomutase  45.52 
 
 		 397 aa  345  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.477667  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2847  phosphopentomutase  44.81 
 
 		 391 aa  343  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06950  phosphopentomutase  48.85 
 
 		 349 aa  342  8e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.56293  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0954  phosphopentomutase  46.46 
 
 		 388 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3449  phosphopentomutase  45.55 
 
 		 388 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1319  phosphopentomutase  46.88 
 
 		 396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0956  phosphopentomutase  46.21 
 
 		 388 aa  336  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0608  phosphopentomutase  45.04 
 
 		 390 aa  335  1e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0905  phosphopentomutase  45.06 
 
 		 391 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0586  phosphopentomutase  45.45 
 
 		 392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.036632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2846  phosphopentomutase  43.8 
 
 		 386 aa  325  1e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0951  phosphopentomutase  44.05 
 
 		 389 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0150  phosphopentomutase  44.89 
 
 		 381 aa  320  3e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.51514  normal  0.178171 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1004  phosphopentomutase  42.36 
 
 		 405 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3091  phosphopentomutase  43.18 
 
 		 384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0618419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002631  phosphopentomutase  42.86 
 
 		 406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2820  phosphopentomutase  42.05 
 
 		 404 aa  305  7e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.776511  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0829  phosphopentomutase  42.68 
 
 		 407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3496  phosphopentomutase  42.68 
 
 		 407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3625  phosphopentomutase  42.68 
 
 		 407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.871395  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4181  phosphopentomutase  42.14 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0823  phosphopentomutase  42.22 
 
 		 407 aa  300  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3228  phosphopentomutase  41.16 
 
 		 404 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0662  phosphopentomutase  42.54 
 
 		 407 aa  300  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf033  phosphopentomutase  42.27 
 
 		 396 aa  300  4e-80  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3547  phosphopentomutase  42.2 
 
 		 405 aa  299  6e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0922116  hitchhiker  0.000231976 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0280  phosphopentomutase  42.89 
 
 		 397 aa  298  1e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.240489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3225  phosphopentomutase  41.16 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0601  phosphopentomutase  42.12 
 
 		 407 aa  297  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03375  phosphopentomutase  42.72 
 
 		 406 aa  297  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3364  phosphopentomutase  41.16 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  hitchhiker  0.00673377 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3615  phosphopentomutase  41.31 
 
 		 407 aa  297  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2863  phosphopentomutase  41.98 
 
 		 415 aa  296  3e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4618  phosphopentomutase  41.31 
 
 		 407 aa  297  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4982  phosphopentomutase  41.31 
 
 		 407 aa  297  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5898  phosphopentomutase  41.31 
 
 		 407 aa  297  3e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3673  phosphopentomutase  41.31 
 
 		 407 aa  297  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.863426  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1142  phosphopentomutase  40.92 
 
 		 404 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000656152 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4932  phosphopentomutase  41.31 
 
 		 407 aa  297  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.912083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4930  phosphopentomutase  41.31 
 
 		 407 aa  297  3e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0975  phosphopentomutase  42.68 
 
 		 407 aa  296  4e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.515828  hitchhiker  0.00460474 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1927  phosphopentomutase  43.46 
 
 		 406 aa  296  5e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04259  phosphopentomutase  41.31 
 
 		 407 aa  296  6e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04225  hypothetical protein  41.31 
 
 		 407 aa  296  6e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.836281  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3345  phosphopentomutase  40.4 
 
 		 406 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4469  phosphopentomutase  41.9 
 
 		 406 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614507  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0621  phosphopentomutase  41.26 
 
 		 406 aa  294  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.482863  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3376  phosphopentomutase  40.1 
 
 		 405 aa  293  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.301348  normal  0.0494326 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3331  phosphopentomutase  41.83 
 
 		 407 aa  293  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00236172  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4891  phosphopentomutase  42.22 
 
 		 407 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0858658  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4925  phosphopentomutase  42.22 
 
 		 407 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.141985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4977  phosphopentomutase  42.22 
 
 		 407 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4823  phosphopentomutase  42.22 
 
 		 407 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3450  phosphopentomutase  42.43 
 
 		 407 aa  292  8e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4984  phosphopentomutase  42.22 
 
 		 407 aa  292  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1219  phosphopentomutase  42.93 
 
 		 404 aa  292  9e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1039  phosphopentomutase  42.68 
 
 		 404 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536446  hitchhiker  0.0000000672539 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>