More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0099 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  100 
 
 
247 aa  509  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  69.29 
 
 
246 aa  354  5.999999999999999e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  66.94 
 
 
246 aa  344  8.999999999999999e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  65.04 
 
 
247 aa  339  2e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  68.33 
 
 
250 aa  337  9.999999999999999e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  65.83 
 
 
249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  65.98 
 
 
244 aa  329  3e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  63.22 
 
 
257 aa  325  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  62.92 
 
 
244 aa  323  1e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  64.17 
 
 
241 aa  322  3e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  62.4 
 
 
257 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  63.18 
 
 
242 aa  320  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  63.18 
 
 
240 aa  315  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  64.85 
 
 
240 aa  314  8e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.92 
 
 
240 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  60.92 
 
 
249 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  60.67 
 
 
240 aa  313  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  61.92 
 
 
246 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  61.09 
 
 
240 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  62.76 
 
 
240 aa  311  3.9999999999999997e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  62.76 
 
 
240 aa  312  3.9999999999999997e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.92 
 
 
240 aa  311  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.92 
 
 
240 aa  311  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.92 
 
 
240 aa  311  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.92 
 
 
240 aa  311  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  63.6 
 
 
244 aa  311  4.999999999999999e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  62.76 
 
 
240 aa  311  5.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  62.76 
 
 
241 aa  310  9e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  61.25 
 
 
242 aa  311  9e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  61.92 
 
 
240 aa  310  9e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  62.76 
 
 
241 aa  310  9e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.92 
 
 
240 aa  310  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  62.76 
 
 
241 aa  310  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.51 
 
 
240 aa  310  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  63.18 
 
 
239 aa  310  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.76 
 
 
240 aa  310  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.25 
 
 
251 aa  310  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.76 
 
 
241 aa  310  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.51 
 
 
240 aa  309  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  60.58 
 
 
242 aa  309  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  62.34 
 
 
241 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  61.67 
 
 
241 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.09 
 
 
240 aa  308  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  60.25 
 
 
240 aa  308  4e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  64.41 
 
 
240 aa  308  4e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  62.61 
 
 
244 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  61.51 
 
 
240 aa  307  8e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  59.17 
 
 
246 aa  307  9e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  60.42 
 
 
262 aa  307  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  62.34 
 
 
241 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  61.25 
 
 
243 aa  306  3e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  61.25 
 
 
269 aa  305  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0414  putative ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 
242 aa  305  5.0000000000000004e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  61.09 
 
 
241 aa  305  6e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  61.25 
 
 
243 aa  304  7e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  61.09 
 
 
241 aa  304  7e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  61.09 
 
 
241 aa  304  7e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  61.25 
 
 
242 aa  303  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  60.83 
 
 
243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.35 
 
 
258 aa  303  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.92 
 
 
273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  59.41 
 
 
255 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  61.09 
 
 
244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  60.67 
 
 
240 aa  302  4.0000000000000003e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1231  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 
242 aa  301  7.000000000000001e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  60.25 
 
 
240 aa  301  8.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  58.61 
 
 
247 aa  301  8.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  60.25 
 
 
241 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  59 
 
 
240 aa  300  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  59.41 
 
 
240 aa  300  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 
242 aa  300  2e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.41 
 
 
244 aa  299  3e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  60 
 
 
257 aa  299  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  59.41 
 
 
246 aa  299  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  59 
 
 
243 aa  298  4e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  58.09 
 
 
257 aa  298  5e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  60 
 
 
242 aa  298  6e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  59.58 
 
 
241 aa  297  9e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  59.15 
 
 
242 aa  296  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  58.2 
 
 
265 aa  296  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  59.5 
 
 
243 aa  296  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  59.67 
 
 
252 aa  296  2e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  59.17 
 
 
244 aa  296  2e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  58.33 
 
 
244 aa  295  3e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  57.61 
 
 
253 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  58.58 
 
 
243 aa  295  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  59.83 
 
 
242 aa  294  8e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  59.83 
 
 
242 aa  294  8e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  59.83 
 
 
244 aa  294  9e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  57.38 
 
 
249 aa  293  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  57.38 
 
 
249 aa  293  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.32 
 
 
240 aa  293  2e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  58.51 
 
 
243 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  57.77 
 
 
267 aa  293  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  59.92 
 
 
243 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  58.33 
 
 
247 aa  292  3e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  59.58 
 
 
247 aa  292  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.38 
 
 
252 aa  292  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  56.85 
 
 
244 aa  292  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 
269 aa  292  4e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>