57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0087 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  75.68 
 
 		 453 aa  703    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  79.82 
 
 		 449 aa  717    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  100 
 
 		 457 aa  924    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  64.27 
 
 		 450 aa  578  1e-164  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  63.68 
 
 		 450 aa  575  1.0000000000000001e-163  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  56.48 
 
 		 471 aa  513  1e-144  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  53.85 
 
 		 448 aa  495  1e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  53.3 
 
 		 453 aa  483  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  48.75 
 
 		 454 aa  450  1e-125  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  50.88 
 
 		 461 aa  447  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  37.76 
 
 		 493 aa  287  2.9999999999999996e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  37.04 
 
 		 498 aa  286  5e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 457 aa  262  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 501 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 448 aa  219  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 510 aa  218  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  29.42 
 
 		 509 aa  217  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 518 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  41.85 
 
 		 507 aa  185  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  39.47 
 
 		 505 aa  184  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  38.02 
 
 		 501 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 458 aa  172  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 502 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0596  major facilitator transporter  42.52 
 
 		 500 aa  171  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.377823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  39.66 
 
 		 502 aa  169  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 524 aa  167  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 530 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  37.82 
 
 		 531 aa  162  9e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  38.96 
 
 		 551 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  35.91 
 
 		 529 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 519 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  37.82 
 
 		 531 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 551 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 551 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 551 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 		 551 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 531 aa  160  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 457 aa  160  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  28.15 
 
 		 443 aa  160  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 514 aa  159  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1021  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 		 495 aa  154  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  27.88 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  26.52 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  23.26 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0819  oligogalacturonide transporter  23 
 
 		 524 aa  52.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2444  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 527 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3542  oligogalacturonide transporter  24.04 
 
 		 519 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3380  oligogalacturonide transporter  24.74 
 
 		 519 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0853  major facilitator superfamily MFS_1  22.27 
 
 		 523 aa  50.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 405 aa  47.4  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  24.84 
 
 		 421 aa  44.7  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  31.25 
 
 		 405 aa  43.5  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  21.68 
 
 		 432 aa  43.1  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>